Protein–RNA interactions for Protein: O88384

Vti1b, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vti1bO88384 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vti1bO88384 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Vti1bO88384 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vti1bO88384 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vti1bO88384 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vti1bO88384 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vti1bO88384 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vti1bO88384 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vti1bO88384 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vti1bO88384 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vti1bO88384 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vti1bO88384 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vti1bO88384 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vti1bO88384 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vti1bO88384 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vti1bO88384 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vti1bO88384 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vti1bO88384 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vti1bO88384 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vti1bO88384 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vti1bO88384 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vti1bO88384 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vti1bO88384 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vti1bO88384 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vti1bO88384 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Vti1bO88384 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vti1bO88384 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vti1bO88384 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vti1bO88384 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Vti1bO88384 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vti1bO88384 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vti1bO88384 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vti1bO88384 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vti1bO88384 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vti1bO88384 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Vti1bO88384 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vti1bO88384 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vti1bO88384 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vti1bO88384 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vti1bO88384 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vti1bO88384 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vti1bO88384 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vti1bO88384 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vti1bO88384 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vti1bO88384 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vti1bO88384 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vti1bO88384 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vti1bO88384 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vti1bO88384 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vti1bO88384 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vti1bO88384 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vti1bO88384 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vti1bO88384 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vti1bO88384 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vti1bO88384 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Vti1bO88384 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Vti1bO88384 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vti1bO88384 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vti1bO88384 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vti1bO88384 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vti1bO88384 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vti1bO88384 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vti1bO88384 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vti1bO88384 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vti1bO88384 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vti1bO88384 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vti1bO88384 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vti1bO88384 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vti1bO88384 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vti1bO88384 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vti1bO88384 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vti1bO88384 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vti1bO88384 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vti1bO88384 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vti1bO88384 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vti1bO88384 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vti1bO88384 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vti1bO88384 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vti1bO88384 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Vti1bO88384 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vti1bO88384 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vti1bO88384 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vti1bO88384 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vti1bO88384 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vti1bO88384 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vti1bO88384 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vti1bO88384 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vti1bO88384 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vti1bO88384 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vti1bO88384 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vti1bO88384 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vti1bO88384 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vti1bO88384 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vti1bO88384 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vti1bO88384 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vti1bO88384 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vti1bO88384 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Vti1bO88384 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vti1bO88384 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vti1bO88384 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms