Protein–RNA interactions for Protein: O88327

Ctnnal1, Alpha-catulin, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnal1O88327 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ctnnal1O88327 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ctnnal1O88327 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ctnnal1O88327 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Ctnnal1O88327 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ctnnal1O88327 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ctnnal1O88327 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ctnnal1O88327 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ctnnal1O88327 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ctnnal1O88327 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ctnnal1O88327 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ctnnal1O88327 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ctnnal1O88327 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ctnnal1O88327 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ctnnal1O88327 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ctnnal1O88327 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ctnnal1O88327 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ctnnal1O88327 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ctnnal1O88327 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ctnnal1O88327 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ctnnal1O88327 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ctnnal1O88327 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ctnnal1O88327 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ctnnal1O88327 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ctnnal1O88327 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ctnnal1O88327 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ctnnal1O88327 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ctnnal1O88327 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ctnnal1O88327 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ctnnal1O88327 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ctnnal1O88327 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ctnnal1O88327 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ctnnal1O88327 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ctnnal1O88327 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ctnnal1O88327 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ctnnal1O88327 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ctnnal1O88327 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ctnnal1O88327 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ctnnal1O88327 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ctnnal1O88327 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ctnnal1O88327 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ctnnal1O88327 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ctnnal1O88327 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ctnnal1O88327 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ctnnal1O88327 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ctnnal1O88327 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ctnnal1O88327 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Ctnnal1O88327 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ctnnal1O88327 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ctnnal1O88327 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ctnnal1O88327 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ctnnal1O88327 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ctnnal1O88327 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ctnnal1O88327 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ctnnal1O88327 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ctnnal1O88327 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ctnnal1O88327 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Ctnnal1O88327 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ctnnal1O88327 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ctnnal1O88327 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ctnnal1O88327 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ctnnal1O88327 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ctnnal1O88327 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ctnnal1O88327 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ctnnal1O88327 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ctnnal1O88327 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ctnnal1O88327 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ctnnal1O88327 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ctnnal1O88327 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ctnnal1O88327 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ctnnal1O88327 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ctnnal1O88327 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ctnnal1O88327 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ctnnal1O88327 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ctnnal1O88327 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ctnnal1O88327 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ctnnal1O88327 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ctnnal1O88327 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ctnnal1O88327 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ctnnal1O88327 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ctnnal1O88327 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ctnnal1O88327 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ctnnal1O88327 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ctnnal1O88327 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ctnnal1O88327 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ctnnal1O88327 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ctnnal1O88327 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ctnnal1O88327 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ctnnal1O88327 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ctnnal1O88327 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ctnnal1O88327 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ctnnal1O88327 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ctnnal1O88327 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ctnnal1O88327 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ctnnal1O88327 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ctnnal1O88327 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ctnnal1O88327 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ctnnal1O88327 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ctnnal1O88327 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ctnnal1O88327 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms