Protein–RNA interactions for Protein: O70157

Top3a, DNA topoisomerase 3-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3aO70157 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Top3aO70157 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Top3aO70157 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Top3aO70157 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Top3aO70157 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Top3aO70157 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Top3aO70157 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Top3aO70157 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Top3aO70157 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Top3aO70157 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Top3aO70157 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Top3aO70157 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Top3aO70157 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Top3aO70157 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Top3aO70157 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Top3aO70157 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Top3aO70157 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Top3aO70157 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Top3aO70157 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Top3aO70157 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Top3aO70157 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Top3aO70157 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Top3aO70157 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Top3aO70157 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Top3aO70157 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Top3aO70157 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Top3aO70157 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Top3aO70157 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Top3aO70157 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Top3aO70157 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Top3aO70157 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Top3aO70157 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Top3aO70157 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Top3aO70157 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Top3aO70157 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Top3aO70157 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Top3aO70157 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Top3aO70157 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Top3aO70157 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Top3aO70157 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Top3aO70157 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Top3aO70157 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Top3aO70157 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Top3aO70157 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Top3aO70157 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Top3aO70157 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Top3aO70157 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Top3aO70157 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Top3aO70157 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Top3aO70157 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Top3aO70157 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Top3aO70157 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Top3aO70157 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Top3aO70157 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Top3aO70157 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Top3aO70157 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Top3aO70157 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Top3aO70157 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Top3aO70157 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Top3aO70157 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Top3aO70157 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Top3aO70157 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Top3aO70157 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Top3aO70157 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Top3aO70157 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Top3aO70157 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Top3aO70157 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Top3aO70157 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Top3aO70157 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Top3aO70157 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Top3aO70157 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Top3aO70157 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Top3aO70157 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Top3aO70157 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Top3aO70157 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Top3aO70157 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Top3aO70157 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Top3aO70157 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Top3aO70157 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Top3aO70157 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Top3aO70157 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Top3aO70157 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Top3aO70157 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Top3aO70157 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Top3aO70157 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Top3aO70157 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Top3aO70157 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Top3aO70157 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Top3aO70157 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Top3aO70157 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Top3aO70157 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Top3aO70157 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Top3aO70157 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Top3aO70157 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Top3aO70157 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Top3aO70157 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Top3aO70157 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Top3aO70157 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Top3aO70157 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Top3aO70157 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms