Protein–RNA interactions for Protein: O55189

Ambn, Ameloblastin, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbnO55189 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AmbnO55189 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AmbnO55189 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AmbnO55189 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AmbnO55189 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AmbnO55189 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AmbnO55189 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AmbnO55189 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AmbnO55189 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AmbnO55189 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AmbnO55189 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
AmbnO55189 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AmbnO55189 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AmbnO55189 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AmbnO55189 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AmbnO55189 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AmbnO55189 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AmbnO55189 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AmbnO55189 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AmbnO55189 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AmbnO55189 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AmbnO55189 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AmbnO55189 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AmbnO55189 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AmbnO55189 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AmbnO55189 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AmbnO55189 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
AmbnO55189 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AmbnO55189 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
AmbnO55189 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AmbnO55189 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AmbnO55189 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AmbnO55189 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AmbnO55189 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AmbnO55189 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AmbnO55189 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AmbnO55189 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AmbnO55189 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
AmbnO55189 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
AmbnO55189 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
AmbnO55189 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AmbnO55189 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AmbnO55189 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AmbnO55189 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AmbnO55189 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AmbnO55189 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AmbnO55189 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AmbnO55189 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AmbnO55189 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AmbnO55189 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AmbnO55189 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
AmbnO55189 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AmbnO55189 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AmbnO55189 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AmbnO55189 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AmbnO55189 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AmbnO55189 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AmbnO55189 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AmbnO55189 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AmbnO55189 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AmbnO55189 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
AmbnO55189 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AmbnO55189 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AmbnO55189 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AmbnO55189 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AmbnO55189 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AmbnO55189 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
AmbnO55189 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AmbnO55189 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AmbnO55189 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AmbnO55189 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AmbnO55189 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AmbnO55189 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AmbnO55189 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AmbnO55189 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AmbnO55189 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AmbnO55189 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AmbnO55189 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AmbnO55189 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AmbnO55189 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AmbnO55189 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AmbnO55189 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AmbnO55189 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AmbnO55189 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AmbnO55189 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AmbnO55189 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AmbnO55189 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AmbnO55189 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AmbnO55189 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AmbnO55189 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AmbnO55189 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AmbnO55189 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AmbnO55189 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AmbnO55189 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AmbnO55189 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AmbnO55189 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AmbnO55189 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AmbnO55189 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AmbnO55189 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AmbnO55189 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms