Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ptpn20O55082 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ptpn20O55082 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ptpn20O55082 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ptpn20O55082 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ptpn20O55082 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ptpn20O55082 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ptpn20O55082 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ptpn20O55082 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ptpn20O55082 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ptpn20O55082 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ptpn20O55082 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ptpn20O55082 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ptpn20O55082 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ptpn20O55082 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ptpn20O55082 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptpn20O55082 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptpn20O55082 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptpn20O55082 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptpn20O55082 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptpn20O55082 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptpn20O55082 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ptpn20O55082 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ptpn20O55082 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ptpn20O55082 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ptpn20O55082 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ptpn20O55082 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ptpn20O55082 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ptpn20O55082 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ptpn20O55082 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ptpn20O55082 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ptpn20O55082 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ptpn20O55082 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ptpn20O55082 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ptpn20O55082 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ptpn20O55082 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ptpn20O55082 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ptpn20O55082 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ptpn20O55082 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ptpn20O55082 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ptpn20O55082 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ptpn20O55082 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ptpn20O55082 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ptpn20O55082 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ptpn20O55082 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ptpn20O55082 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ptpn20O55082 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ptpn20O55082 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ptpn20O55082 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ptpn20O55082 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ptpn20O55082 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ptpn20O55082 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ptpn20O55082 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ptpn20O55082 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ptpn20O55082 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ptpn20O55082 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ptpn20O55082 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ptpn20O55082 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ptpn20O55082 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ptpn20O55082 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ptpn20O55082 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ptpn20O55082 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ptpn20O55082 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ptpn20O55082 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ptpn20O55082 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ptpn20O55082 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ptpn20O55082 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ptpn20O55082 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ptpn20O55082 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ptpn20O55082 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ptpn20O55082 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ptpn20O55082 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ptpn20O55082 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ptpn20O55082 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ptpn20O55082 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ptpn20O55082 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ptpn20O55082 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ptpn20O55082 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ptpn20O55082 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ptpn20O55082 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ptpn20O55082 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ptpn20O55082 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ptpn20O55082 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ptpn20O55082 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ptpn20O55082 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ptpn20O55082 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ptpn20O55082 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ptpn20O55082 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ptpn20O55082 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ptpn20O55082 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Ptpn20O55082 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ptpn20O55082 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ptpn20O55082 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ptpn20O55082 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ptpn20O55082 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ptpn20O55082 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ptpn20O55082 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ptpn20O55082 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ptpn20O55082 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ptpn20O55082 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.5 ms