Protein–RNA interactions for Protein: O54956

Pole2, DNA polymerase epsilon subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole2O54956 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pole2O54956 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pole2O54956 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pole2O54956 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pole2O54956 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pole2O54956 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pole2O54956 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pole2O54956 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pole2O54956 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Pole2O54956 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pole2O54956 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pole2O54956 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pole2O54956 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pole2O54956 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pole2O54956 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pole2O54956 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pole2O54956 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pole2O54956 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pole2O54956 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pole2O54956 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pole2O54956 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pole2O54956 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pole2O54956 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pole2O54956 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pole2O54956 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pole2O54956 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pole2O54956 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pole2O54956 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pole2O54956 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pole2O54956 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pole2O54956 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pole2O54956 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pole2O54956 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pole2O54956 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pole2O54956 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pole2O54956 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pole2O54956 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pole2O54956 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pole2O54956 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pole2O54956 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pole2O54956 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pole2O54956 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pole2O54956 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pole2O54956 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pole2O54956 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pole2O54956 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pole2O54956 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pole2O54956 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pole2O54956 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pole2O54956 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pole2O54956 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pole2O54956 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pole2O54956 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pole2O54956 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pole2O54956 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pole2O54956 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pole2O54956 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pole2O54956 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pole2O54956 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pole2O54956 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pole2O54956 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pole2O54956 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pole2O54956 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pole2O54956 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Pole2O54956 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pole2O54956 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pole2O54956 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pole2O54956 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pole2O54956 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pole2O54956 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Pole2O54956 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Pole2O54956 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pole2O54956 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pole2O54956 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pole2O54956 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pole2O54956 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pole2O54956 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pole2O54956 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pole2O54956 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pole2O54956 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pole2O54956 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pole2O54956 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pole2O54956 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pole2O54956 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pole2O54956 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pole2O54956 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pole2O54956 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pole2O54956 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pole2O54956 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pole2O54956 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pole2O54956 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pole2O54956 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pole2O54956 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pole2O54956 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pole2O54956 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pole2O54956 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pole2O54956 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pole2O54956 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pole2O54956 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Pole2O54956 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98 ms