Protein–RNA interactions for Protein: O54949

Nlk, Serine/threonine-protein kinase NLK, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NlkO54949 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NlkO54949 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NlkO54949 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
NlkO54949 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NlkO54949 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NlkO54949 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NlkO54949 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NlkO54949 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NlkO54949 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NlkO54949 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
NlkO54949 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NlkO54949 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NlkO54949 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NlkO54949 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NlkO54949 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NlkO54949 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NlkO54949 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NlkO54949 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NlkO54949 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NlkO54949 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NlkO54949 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NlkO54949 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NlkO54949 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NlkO54949 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NlkO54949 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NlkO54949 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NlkO54949 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NlkO54949 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NlkO54949 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NlkO54949 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NlkO54949 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NlkO54949 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
NlkO54949 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NlkO54949 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NlkO54949 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NlkO54949 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NlkO54949 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NlkO54949 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NlkO54949 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NlkO54949 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NlkO54949 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NlkO54949 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NlkO54949 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NlkO54949 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NlkO54949 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NlkO54949 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NlkO54949 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NlkO54949 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NlkO54949 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NlkO54949 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NlkO54949 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NlkO54949 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NlkO54949 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NlkO54949 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NlkO54949 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NlkO54949 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NlkO54949 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NlkO54949 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NlkO54949 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NlkO54949 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NlkO54949 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NlkO54949 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NlkO54949 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NlkO54949 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NlkO54949 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NlkO54949 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NlkO54949 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NlkO54949 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NlkO54949 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NlkO54949 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NlkO54949 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NlkO54949 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NlkO54949 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NlkO54949 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NlkO54949 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NlkO54949 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NlkO54949 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NlkO54949 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NlkO54949 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NlkO54949 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NlkO54949 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NlkO54949 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NlkO54949 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NlkO54949 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NlkO54949 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NlkO54949 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NlkO54949 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NlkO54949 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NlkO54949 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NlkO54949 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NlkO54949 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NlkO54949 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NlkO54949 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NlkO54949 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NlkO54949 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NlkO54949 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NlkO54949 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NlkO54949 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NlkO54949 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NlkO54949 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71 ms