Protein–RNA interactions for Protein: O54915

Nr1i2, Nuclear receptor subfamily 1 group I member 2, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1i2O54915 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nr1i2O54915 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nr1i2O54915 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nr1i2O54915 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nr1i2O54915 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nr1i2O54915 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nr1i2O54915 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Nr1i2O54915 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nr1i2O54915 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Nr1i2O54915 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nr1i2O54915 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nr1i2O54915 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nr1i2O54915 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nr1i2O54915 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nr1i2O54915 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nr1i2O54915 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nr1i2O54915 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nr1i2O54915 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nr1i2O54915 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nr1i2O54915 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Nr1i2O54915 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nr1i2O54915 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nr1i2O54915 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nr1i2O54915 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nr1i2O54915 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nr1i2O54915 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nr1i2O54915 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nr1i2O54915 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nr1i2O54915 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nr1i2O54915 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nr1i2O54915 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nr1i2O54915 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Nr1i2O54915 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Nr1i2O54915 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Nr1i2O54915 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nr1i2O54915 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nr1i2O54915 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nr1i2O54915 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nr1i2O54915 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nr1i2O54915 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nr1i2O54915 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nr1i2O54915 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nr1i2O54915 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nr1i2O54915 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nr1i2O54915 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nr1i2O54915 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nr1i2O54915 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nr1i2O54915 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nr1i2O54915 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nr1i2O54915 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nr1i2O54915 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nr1i2O54915 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nr1i2O54915 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nr1i2O54915 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nr1i2O54915 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Nr1i2O54915 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nr1i2O54915 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nr1i2O54915 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nr1i2O54915 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nr1i2O54915 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nr1i2O54915 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nr1i2O54915 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nr1i2O54915 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nr1i2O54915 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nr1i2O54915 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nr1i2O54915 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Nr1i2O54915 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nr1i2O54915 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Nr1i2O54915 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Nr1i2O54915 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Nr1i2O54915 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nr1i2O54915 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nr1i2O54915 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nr1i2O54915 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nr1i2O54915 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nr1i2O54915 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nr1i2O54915 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nr1i2O54915 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nr1i2O54915 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nr1i2O54915 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nr1i2O54915 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nr1i2O54915 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nr1i2O54915 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nr1i2O54915 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nr1i2O54915 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nr1i2O54915 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nr1i2O54915 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Nr1i2O54915 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nr1i2O54915 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nr1i2O54915 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nr1i2O54915 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nr1i2O54915 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nr1i2O54915 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nr1i2O54915 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nr1i2O54915 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Nr1i2O54915 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nr1i2O54915 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nr1i2O54915 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nr1i2O54915 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nr1i2O54915 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms