Protein–RNA interactions for Protein: O35473

C1d, Nuclear nucleic acid-binding protein C1D, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1dO35473 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1dO35473 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1dO35473 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1dO35473 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1dO35473 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1dO35473 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1dO35473 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1dO35473 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1dO35473 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1dO35473 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1dO35473 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1dO35473 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1dO35473 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1dO35473 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1dO35473 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1dO35473 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1dO35473 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1dO35473 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1dO35473 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1dO35473 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1dO35473 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1dO35473 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1dO35473 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1dO35473 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1dO35473 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C1dO35473 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C1dO35473 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1dO35473 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1dO35473 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1dO35473 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1dO35473 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1dO35473 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1dO35473 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1dO35473 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1dO35473 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1dO35473 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1dO35473 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1dO35473 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1dO35473 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1dO35473 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1dO35473 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1dO35473 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1dO35473 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1dO35473 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1dO35473 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1dO35473 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1dO35473 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1dO35473 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1dO35473 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
C1dO35473 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1dO35473 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
C1dO35473 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C1dO35473 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C1dO35473 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
C1dO35473 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C1dO35473 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
C1dO35473 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C1dO35473 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C1dO35473 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C1dO35473 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C1dO35473 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C1dO35473 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C1dO35473 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C1dO35473 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C1dO35473 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C1dO35473 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C1dO35473 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C1dO35473 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C1dO35473 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C1dO35473 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
C1dO35473 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C1dO35473 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C1dO35473 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C1dO35473 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C1dO35473 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C1dO35473 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
C1dO35473 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C1dO35473 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C1dO35473 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C1dO35473 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C1dO35473 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C1dO35473 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C1dO35473 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C1dO35473 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C1dO35473 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C1dO35473 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C1dO35473 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C1dO35473 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C1dO35473 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C1dO35473 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C1dO35473 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C1dO35473 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C1dO35473 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C1dO35473 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C1dO35473 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C1dO35473 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C1dO35473 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C1dO35473 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C1dO35473 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C1dO35473 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms