Protein–RNA interactions for Protein: O35427

Crcp, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC9, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrcpO35427 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CrcpO35427 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CrcpO35427 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CrcpO35427 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CrcpO35427 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CrcpO35427 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CrcpO35427 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CrcpO35427 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CrcpO35427 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CrcpO35427 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CrcpO35427 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CrcpO35427 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CrcpO35427 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CrcpO35427 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CrcpO35427 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CrcpO35427 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CrcpO35427 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CrcpO35427 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CrcpO35427 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CrcpO35427 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CrcpO35427 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CrcpO35427 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CrcpO35427 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CrcpO35427 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CrcpO35427 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CrcpO35427 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CrcpO35427 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CrcpO35427 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CrcpO35427 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CrcpO35427 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CrcpO35427 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CrcpO35427 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CrcpO35427 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CrcpO35427 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CrcpO35427 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CrcpO35427 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CrcpO35427 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CrcpO35427 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CrcpO35427 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CrcpO35427 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CrcpO35427 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CrcpO35427 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CrcpO35427 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CrcpO35427 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CrcpO35427 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CrcpO35427 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CrcpO35427 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CrcpO35427 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CrcpO35427 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CrcpO35427 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CrcpO35427 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CrcpO35427 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CrcpO35427 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CrcpO35427 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CrcpO35427 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CrcpO35427 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CrcpO35427 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CrcpO35427 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CrcpO35427 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CrcpO35427 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CrcpO35427 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CrcpO35427 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CrcpO35427 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CrcpO35427 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CrcpO35427 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CrcpO35427 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CrcpO35427 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CrcpO35427 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CrcpO35427 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CrcpO35427 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CrcpO35427 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CrcpO35427 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CrcpO35427 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CrcpO35427 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CrcpO35427 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CrcpO35427 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CrcpO35427 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CrcpO35427 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CrcpO35427 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CrcpO35427 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CrcpO35427 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CrcpO35427 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CrcpO35427 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CrcpO35427 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CrcpO35427 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CrcpO35427 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CrcpO35427 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CrcpO35427 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CrcpO35427 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CrcpO35427 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CrcpO35427 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CrcpO35427 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CrcpO35427 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CrcpO35427 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CrcpO35427 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CrcpO35427 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CrcpO35427 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CrcpO35427 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CrcpO35427 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CrcpO35427 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms