Protein–RNA interactions for Protein: O35393

Efnb3, Ephrin-B3, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb3O35393 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Efnb3O35393 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Efnb3O35393 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Efnb3O35393 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Efnb3O35393 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Efnb3O35393 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Efnb3O35393 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Efnb3O35393 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Efnb3O35393 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Efnb3O35393 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efnb3O35393 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efnb3O35393 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efnb3O35393 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efnb3O35393 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efnb3O35393 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efnb3O35393 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efnb3O35393 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efnb3O35393 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efnb3O35393 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efnb3O35393 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Efnb3O35393 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Efnb3O35393 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Efnb3O35393 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Efnb3O35393 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Efnb3O35393 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Efnb3O35393 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Efnb3O35393 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Efnb3O35393 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Efnb3O35393 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Efnb3O35393 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efnb3O35393 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efnb3O35393 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efnb3O35393 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efnb3O35393 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Efnb3O35393 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Efnb3O35393 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Efnb3O35393 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Efnb3O35393 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Efnb3O35393 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Efnb3O35393 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Efnb3O35393 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Efnb3O35393 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Efnb3O35393 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Efnb3O35393 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Efnb3O35393 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Efnb3O35393 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Efnb3O35393 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Efnb3O35393 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Efnb3O35393 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Efnb3O35393 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efnb3O35393 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efnb3O35393 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Efnb3O35393 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Efnb3O35393 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efnb3O35393 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efnb3O35393 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Efnb3O35393 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Efnb3O35393 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efnb3O35393 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efnb3O35393 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efnb3O35393 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Efnb3O35393 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efnb3O35393 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efnb3O35393 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efnb3O35393 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efnb3O35393 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efnb3O35393 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efnb3O35393 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efnb3O35393 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efnb3O35393 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efnb3O35393 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Efnb3O35393 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efnb3O35393 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efnb3O35393 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efnb3O35393 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Efnb3O35393 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Efnb3O35393 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Efnb3O35393 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Efnb3O35393 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Efnb3O35393 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Efnb3O35393 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Efnb3O35393 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Efnb3O35393 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Efnb3O35393 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Efnb3O35393 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Efnb3O35393 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Efnb3O35393 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Efnb3O35393 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Efnb3O35393 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Efnb3O35393 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Efnb3O35393 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Efnb3O35393 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Efnb3O35393 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Efnb3O35393 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Efnb3O35393 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Efnb3O35393 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Efnb3O35393 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Efnb3O35393 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Efnb3O35393 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Efnb3O35393 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms