Protein–RNA interactions for Protein: O35326

Srsf5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf5O35326 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Srsf5O35326 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Srsf5O35326 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Srsf5O35326 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Srsf5O35326 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Srsf5O35326 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Srsf5O35326 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Srsf5O35326 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Srsf5O35326 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Srsf5O35326 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Srsf5O35326 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Srsf5O35326 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Srsf5O35326 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Srsf5O35326 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Srsf5O35326 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Srsf5O35326 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Srsf5O35326 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Srsf5O35326 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Srsf5O35326 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Srsf5O35326 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Srsf5O35326 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Srsf5O35326 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Srsf5O35326 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Srsf5O35326 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Srsf5O35326 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Srsf5O35326 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Srsf5O35326 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Srsf5O35326 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Srsf5O35326 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Srsf5O35326 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Srsf5O35326 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Srsf5O35326 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Srsf5O35326 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Srsf5O35326 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Srsf5O35326 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Srsf5O35326 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Srsf5O35326 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Srsf5O35326 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Srsf5O35326 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Srsf5O35326 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Srsf5O35326 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Srsf5O35326 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Srsf5O35326 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Srsf5O35326 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Srsf5O35326 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Srsf5O35326 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Srsf5O35326 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Srsf5O35326 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Srsf5O35326 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Srsf5O35326 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Srsf5O35326 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Srsf5O35326 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Srsf5O35326 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Srsf5O35326 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Srsf5O35326 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Srsf5O35326 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Srsf5O35326 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Srsf5O35326 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Srsf5O35326 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Srsf5O35326 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Srsf5O35326 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Srsf5O35326 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Srsf5O35326 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Srsf5O35326 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Srsf5O35326 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Srsf5O35326 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Srsf5O35326 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Srsf5O35326 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Srsf5O35326 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Srsf5O35326 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Srsf5O35326 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Srsf5O35326 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Srsf5O35326 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Srsf5O35326 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Srsf5O35326 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Srsf5O35326 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Srsf5O35326 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Srsf5O35326 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Srsf5O35326 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Srsf5O35326 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Srsf5O35326 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Srsf5O35326 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Srsf5O35326 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Srsf5O35326 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Srsf5O35326 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Srsf5O35326 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Srsf5O35326 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Srsf5O35326 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Srsf5O35326 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Srsf5O35326 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Srsf5O35326 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Srsf5O35326 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Srsf5O35326 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Srsf5O35326 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Srsf5O35326 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Srsf5O35326 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Srsf5O35326 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Srsf5O35326 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Srsf5O35326 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Srsf5O35326 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms