Protein–RNA interactions for Protein: O35305

Tnfrsf11a, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 11A, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf11aO35305 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tnfrsf11aO35305 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Tnfrsf11aO35305 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tnfrsf11aO35305 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tnfrsf11aO35305 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tnfrsf11aO35305 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tnfrsf11aO35305 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tnfrsf11aO35305 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tnfrsf11aO35305 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tnfrsf11aO35305 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tnfrsf11aO35305 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tnfrsf11aO35305 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tnfrsf11aO35305 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tnfrsf11aO35305 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tnfrsf11aO35305 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tnfrsf11aO35305 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Tnfrsf11aO35305 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tnfrsf11aO35305 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tnfrsf11aO35305 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tnfrsf11aO35305 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tnfrsf11aO35305 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tnfrsf11aO35305 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tnfrsf11aO35305 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tnfrsf11aO35305 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tnfrsf11aO35305 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tnfrsf11aO35305 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tnfrsf11aO35305 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tnfrsf11aO35305 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tnfrsf11aO35305 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tnfrsf11aO35305 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tnfrsf11aO35305 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tnfrsf11aO35305 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tnfrsf11aO35305 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tnfrsf11aO35305 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tnfrsf11aO35305 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tnfrsf11aO35305 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tnfrsf11aO35305 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tnfrsf11aO35305 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tnfrsf11aO35305 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tnfrsf11aO35305 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tnfrsf11aO35305 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tnfrsf11aO35305 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tnfrsf11aO35305 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Tnfrsf11aO35305 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tnfrsf11aO35305 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tnfrsf11aO35305 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tnfrsf11aO35305 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Tnfrsf11aO35305 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tnfrsf11aO35305 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tnfrsf11aO35305 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tnfrsf11aO35305 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tnfrsf11aO35305 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tnfrsf11aO35305 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tnfrsf11aO35305 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tnfrsf11aO35305 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tnfrsf11aO35305 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tnfrsf11aO35305 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tnfrsf11aO35305 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tnfrsf11aO35305 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tnfrsf11aO35305 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Tnfrsf11aO35305 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tnfrsf11aO35305 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tnfrsf11aO35305 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tnfrsf11aO35305 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tnfrsf11aO35305 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tnfrsf11aO35305 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tnfrsf11aO35305 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tnfrsf11aO35305 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tnfrsf11aO35305 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tnfrsf11aO35305 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tnfrsf11aO35305 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tnfrsf11aO35305 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tnfrsf11aO35305 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tnfrsf11aO35305 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tnfrsf11aO35305 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tnfrsf11aO35305 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Tnfrsf11aO35305 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tnfrsf11aO35305 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tnfrsf11aO35305 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tnfrsf11aO35305 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Tnfrsf11aO35305 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tnfrsf11aO35305 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tnfrsf11aO35305 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tnfrsf11aO35305 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tnfrsf11aO35305 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tnfrsf11aO35305 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tnfrsf11aO35305 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tnfrsf11aO35305 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tnfrsf11aO35305 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tnfrsf11aO35305 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tnfrsf11aO35305 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tnfrsf11aO35305 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tnfrsf11aO35305 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tnfrsf11aO35305 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tnfrsf11aO35305 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tnfrsf11aO35305 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tnfrsf11aO35305 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tnfrsf11aO35305 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tnfrsf11aO35305 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tnfrsf11aO35305 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms