Protein–RNA interactions for Protein: O35261

E2f3, Transcription factor E2F3, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f3O35261 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
E2f3O35261 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
E2f3O35261 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
E2f3O35261 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
E2f3O35261 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
E2f3O35261 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
E2f3O35261 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
E2f3O35261 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
E2f3O35261 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
E2f3O35261 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
E2f3O35261 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
E2f3O35261 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
E2f3O35261 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
E2f3O35261 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
E2f3O35261 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
E2f3O35261 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
E2f3O35261 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
E2f3O35261 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
E2f3O35261 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
E2f3O35261 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
E2f3O35261 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
E2f3O35261 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
E2f3O35261 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
E2f3O35261 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
E2f3O35261 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
E2f3O35261 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
E2f3O35261 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
E2f3O35261 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
E2f3O35261 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
E2f3O35261 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
E2f3O35261 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
E2f3O35261 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
E2f3O35261 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
E2f3O35261 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
E2f3O35261 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
E2f3O35261 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
E2f3O35261 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
E2f3O35261 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
E2f3O35261 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
E2f3O35261 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
E2f3O35261 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
E2f3O35261 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
E2f3O35261 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
E2f3O35261 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
E2f3O35261 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
E2f3O35261 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
E2f3O35261 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
E2f3O35261 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
E2f3O35261 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
E2f3O35261 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
E2f3O35261 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
E2f3O35261 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
E2f3O35261 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
E2f3O35261 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
E2f3O35261 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
E2f3O35261 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
E2f3O35261 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
E2f3O35261 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
E2f3O35261 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
E2f3O35261 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
E2f3O35261 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
E2f3O35261 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
E2f3O35261 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
E2f3O35261 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
E2f3O35261 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
E2f3O35261 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
E2f3O35261 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
E2f3O35261 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
E2f3O35261 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
E2f3O35261 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
E2f3O35261 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
E2f3O35261 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
E2f3O35261 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
E2f3O35261 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
E2f3O35261 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
E2f3O35261 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
E2f3O35261 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
E2f3O35261 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
E2f3O35261 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
E2f3O35261 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
E2f3O35261 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
E2f3O35261 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
E2f3O35261 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
E2f3O35261 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
E2f3O35261 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
E2f3O35261 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
E2f3O35261 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
E2f3O35261 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
E2f3O35261 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
E2f3O35261 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
E2f3O35261 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
E2f3O35261 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
E2f3O35261 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
E2f3O35261 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
E2f3O35261 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
E2f3O35261 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
E2f3O35261 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
E2f3O35261 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
E2f3O35261 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
E2f3O35261 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms