Protein–RNA interactions for Protein: O35125

Lrrc23, Leucine-rich repeat-containing protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc23O35125 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc23O35125 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc23O35125 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc23O35125 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc23O35125 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc23O35125 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc23O35125 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrc23O35125 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrc23O35125 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc23O35125 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc23O35125 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrc23O35125 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrc23O35125 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrc23O35125 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lrrc23O35125 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrc23O35125 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrc23O35125 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrc23O35125 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrc23O35125 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrc23O35125 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrc23O35125 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrc23O35125 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrc23O35125 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrc23O35125 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrc23O35125 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrc23O35125 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrc23O35125 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrc23O35125 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrc23O35125 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrc23O35125 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrc23O35125 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrc23O35125 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrc23O35125 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrc23O35125 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrrc23O35125 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrrc23O35125 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrrc23O35125 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrrc23O35125 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrrc23O35125 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrrc23O35125 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrrc23O35125 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrrc23O35125 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrrc23O35125 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrrc23O35125 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrc23O35125 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrc23O35125 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrc23O35125 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrc23O35125 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrc23O35125 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrc23O35125 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrc23O35125 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrc23O35125 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrc23O35125 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrc23O35125 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrc23O35125 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrc23O35125 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrc23O35125 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrc23O35125 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrc23O35125 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrc23O35125 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrc23O35125 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrc23O35125 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrc23O35125 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrc23O35125 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrc23O35125 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrc23O35125 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Lrrc23O35125 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrrc23O35125 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrrc23O35125 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrc23O35125 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrc23O35125 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrrc23O35125 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrrc23O35125 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrrc23O35125 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrrc23O35125 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrrc23O35125 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrc23O35125 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrc23O35125 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrrc23O35125 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrrc23O35125 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrrc23O35125 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrrc23O35125 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrrc23O35125 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lrrc23O35125 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lrrc23O35125 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrrc23O35125 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrrc23O35125 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrrc23O35125 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrrc23O35125 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrrc23O35125 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrrc23O35125 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrrc23O35125 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrc23O35125 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrc23O35125 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrc23O35125 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrc23O35125 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrc23O35125 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrc23O35125 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrc23O35125 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrc23O35125 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.3 ms