Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2-Q1O19441 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2-Q1O19441 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2-Q1O19441 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2-Q1O19441 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2-Q1O19441 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2-Q1O19441 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2-Q1O19441 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2-Q1O19441 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2-Q1O19441 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2-Q1O19441 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
H2-Q1O19441 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2-Q1O19441 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2-Q1O19441 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2-Q1O19441 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2-Q1O19441 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2-Q1O19441 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2-Q1O19441 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2-Q1O19441 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2-Q1O19441 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2-Q1O19441 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2-Q1O19441 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2-Q1O19441 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2-Q1O19441 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2-Q1O19441 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2-Q1O19441 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
H2-Q1O19441 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2-Q1O19441 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2-Q1O19441 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2-Q1O19441 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
H2-Q1O19441 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2-Q1O19441 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2-Q1O19441 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2-Q1O19441 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2-Q1O19441 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2-Q1O19441 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2-Q1O19441 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2-Q1O19441 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
H2-Q1O19441 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H2-Q1O19441 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H2-Q1O19441 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
H2-Q1O19441 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2-Q1O19441 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2-Q1O19441 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2-Q1O19441 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2-Q1O19441 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2-Q1O19441 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
H2-Q1O19441 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2-Q1O19441 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2-Q1O19441 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2-Q1O19441 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2-Q1O19441 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2-Q1O19441 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2-Q1O19441 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2-Q1O19441 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2-Q1O19441 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2-Q1O19441 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2-Q1O19441 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2-Q1O19441 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2-Q1O19441 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2-Q1O19441 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
H2-Q1O19441 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
H2-Q1O19441 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
H2-Q1O19441 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
H2-Q1O19441 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
H2-Q1O19441 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
H2-Q1O19441 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2-Q1O19441 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2-Q1O19441 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2-Q1O19441 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2-Q1O19441 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2-Q1O19441 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2-Q1O19441 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2-Q1O19441 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2-Q1O19441 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2-Q1O19441 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2-Q1O19441 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2-Q1O19441 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2-Q1O19441 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2-Q1O19441 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H2-Q1O19441 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
H2-Q1O19441 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
H2-Q1O19441 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H2-Q1O19441 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H2-Q1O19441 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H2-Q1O19441 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H2-Q1O19441 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2-Q1O19441 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2-Q1O19441 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2-Q1O19441 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2-Q1O19441 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2-Q1O19441 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2-Q1O19441 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2-Q1O19441 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2-Q1O19441 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2-Q1O19441 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2-Q1O19441 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2-Q1O19441 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2-Q1O19441 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
H2-Q1O19441 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 152.8 ms