Protein–RNA interactions for Protein: O08848

Trove2, 60 kDa SS-A/Ro ribonucleoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trove2O08848 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trove2O08848 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trove2O08848 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trove2O08848 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trove2O08848 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trove2O08848 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trove2O08848 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trove2O08848 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trove2O08848 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trove2O08848 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trove2O08848 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trove2O08848 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trove2O08848 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trove2O08848 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trove2O08848 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trove2O08848 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trove2O08848 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Trove2O08848 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trove2O08848 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trove2O08848 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trove2O08848 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trove2O08848 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trove2O08848 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trove2O08848 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trove2O08848 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trove2O08848 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trove2O08848 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trove2O08848 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trove2O08848 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Trove2O08848 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trove2O08848 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trove2O08848 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trove2O08848 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trove2O08848 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trove2O08848 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trove2O08848 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trove2O08848 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trove2O08848 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trove2O08848 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trove2O08848 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trove2O08848 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trove2O08848 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trove2O08848 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trove2O08848 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trove2O08848 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Trove2O08848 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Trove2O08848 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trove2O08848 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trove2O08848 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Trove2O08848 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trove2O08848 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trove2O08848 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trove2O08848 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trove2O08848 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trove2O08848 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trove2O08848 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trove2O08848 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trove2O08848 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trove2O08848 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trove2O08848 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trove2O08848 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trove2O08848 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trove2O08848 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trove2O08848 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trove2O08848 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trove2O08848 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trove2O08848 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trove2O08848 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trove2O08848 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trove2O08848 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trove2O08848 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trove2O08848 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trove2O08848 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trove2O08848 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trove2O08848 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trove2O08848 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trove2O08848 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trove2O08848 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trove2O08848 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trove2O08848 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trove2O08848 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trove2O08848 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trove2O08848 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trove2O08848 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trove2O08848 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trove2O08848 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trove2O08848 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trove2O08848 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trove2O08848 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trove2O08848 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trove2O08848 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trove2O08848 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trove2O08848 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trove2O08848 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trove2O08848 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trove2O08848 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trove2O08848 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trove2O08848 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trove2O08848 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trove2O08848 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.7 ms