Protein–RNA interactions for Protein: O08842

Gfra2, GDNF family receptor alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra2O08842 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Gfra2O08842 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gfra2O08842 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Gfra2O08842 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gfra2O08842 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gfra2O08842 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gfra2O08842 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gfra2O08842 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gfra2O08842 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gfra2O08842 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gfra2O08842 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gfra2O08842 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gfra2O08842 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gfra2O08842 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gfra2O08842 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gfra2O08842 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gfra2O08842 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gfra2O08842 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gfra2O08842 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gfra2O08842 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gfra2O08842 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Gfra2O08842 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Gfra2O08842 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gfra2O08842 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gfra2O08842 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gfra2O08842 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gfra2O08842 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gfra2O08842 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gfra2O08842 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Gfra2O08842 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gfra2O08842 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gfra2O08842 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gfra2O08842 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gfra2O08842 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gfra2O08842 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gfra2O08842 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gfra2O08842 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gfra2O08842 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gfra2O08842 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Gfra2O08842 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gfra2O08842 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gfra2O08842 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gfra2O08842 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gfra2O08842 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gfra2O08842 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gfra2O08842 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gfra2O08842 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gfra2O08842 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gfra2O08842 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gfra2O08842 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gfra2O08842 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gfra2O08842 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gfra2O08842 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gfra2O08842 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gfra2O08842 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Gfra2O08842 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gfra2O08842 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gfra2O08842 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gfra2O08842 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gfra2O08842 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gfra2O08842 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Gfra2O08842 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gfra2O08842 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gfra2O08842 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gfra2O08842 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Gfra2O08842 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gfra2O08842 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gfra2O08842 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gfra2O08842 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gfra2O08842 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gfra2O08842 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gfra2O08842 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gfra2O08842 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gfra2O08842 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gfra2O08842 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gfra2O08842 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Gfra2O08842 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gfra2O08842 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gfra2O08842 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gfra2O08842 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gfra2O08842 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gfra2O08842 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gfra2O08842 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gfra2O08842 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gfra2O08842 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Gfra2O08842 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gfra2O08842 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gfra2O08842 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gfra2O08842 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Gfra2O08842 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gfra2O08842 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gfra2O08842 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gfra2O08842 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gfra2O08842 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gfra2O08842 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gfra2O08842 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gfra2O08842 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gfra2O08842 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gfra2O08842 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Gfra2O08842 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.6 ms