Protein–RNA interactions for Protein: O08742

Gp5, Platelet glycoprotein V, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp5O08742 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gp5O08742 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Gp5O08742 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gp5O08742 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gp5O08742 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gp5O08742 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gp5O08742 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gp5O08742 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gp5O08742 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gp5O08742 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gp5O08742 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gp5O08742 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gp5O08742 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gp5O08742 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Gp5O08742 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gp5O08742 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gp5O08742 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gp5O08742 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gp5O08742 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gp5O08742 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gp5O08742 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gp5O08742 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gp5O08742 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gp5O08742 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gp5O08742 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gp5O08742 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Gp5O08742 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gp5O08742 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gp5O08742 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gp5O08742 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gp5O08742 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gp5O08742 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gp5O08742 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gp5O08742 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gp5O08742 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gp5O08742 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gp5O08742 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gp5O08742 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gp5O08742 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gp5O08742 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gp5O08742 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gp5O08742 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gp5O08742 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gp5O08742 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gp5O08742 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gp5O08742 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gp5O08742 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gp5O08742 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gp5O08742 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gp5O08742 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gp5O08742 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gp5O08742 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gp5O08742 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gp5O08742 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gp5O08742 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gp5O08742 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gp5O08742 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gp5O08742 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gp5O08742 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gp5O08742 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gp5O08742 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gp5O08742 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gp5O08742 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gp5O08742 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gp5O08742 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gp5O08742 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gp5O08742 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gp5O08742 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gp5O08742 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gp5O08742 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Gp5O08742 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gp5O08742 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gp5O08742 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gp5O08742 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gp5O08742 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gp5O08742 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gp5O08742 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gp5O08742 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gp5O08742 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gp5O08742 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gp5O08742 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gp5O08742 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gp5O08742 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gp5O08742 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gp5O08742 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gp5O08742 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gp5O08742 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gp5O08742 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gp5O08742 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gp5O08742 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gp5O08742 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gp5O08742 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gp5O08742 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gp5O08742 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gp5O08742 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gp5O08742 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gp5O08742 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gp5O08742 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gp5O08742 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gp5O08742 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms