Protein–RNA interactions for Protein: O08543

Efna5, Ephrin-A5, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna5O08543 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Efna5O08543 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Efna5O08543 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Efna5O08543 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Efna5O08543 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Efna5O08543 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Efna5O08543 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Efna5O08543 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Efna5O08543 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Efna5O08543 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Efna5O08543 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Efna5O08543 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Efna5O08543 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Efna5O08543 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Efna5O08543 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Efna5O08543 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Efna5O08543 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Efna5O08543 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Efna5O08543 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Efna5O08543 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Efna5O08543 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Efna5O08543 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Efna5O08543 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Efna5O08543 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Efna5O08543 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Efna5O08543 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Efna5O08543 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Efna5O08543 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Efna5O08543 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Efna5O08543 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Efna5O08543 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Efna5O08543 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Efna5O08543 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Efna5O08543 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Efna5O08543 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Efna5O08543 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Efna5O08543 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Efna5O08543 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Efna5O08543 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Efna5O08543 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Efna5O08543 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Efna5O08543 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Efna5O08543 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Efna5O08543 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Efna5O08543 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Efna5O08543 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Efna5O08543 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Efna5O08543 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Efna5O08543 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Efna5O08543 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Efna5O08543 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Efna5O08543 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Efna5O08543 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Efna5O08543 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Efna5O08543 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Efna5O08543 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Efna5O08543 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Efna5O08543 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Efna5O08543 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Efna5O08543 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Efna5O08543 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Efna5O08543 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Efna5O08543 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Efna5O08543 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Efna5O08543 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Efna5O08543 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Efna5O08543 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Efna5O08543 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Efna5O08543 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Efna5O08543 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Efna5O08543 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Efna5O08543 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Efna5O08543 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Efna5O08543 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Efna5O08543 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Efna5O08543 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Efna5O08543 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Efna5O08543 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Efna5O08543 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Efna5O08543 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Efna5O08543 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Efna5O08543 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Efna5O08543 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Efna5O08543 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Efna5O08543 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Efna5O08543 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Efna5O08543 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Efna5O08543 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Efna5O08543 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Efna5O08543 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Efna5O08543 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Efna5O08543 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Efna5O08543 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Efna5O08543 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Efna5O08543 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Efna5O08543 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Efna5O08543 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Efna5O08543 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Efna5O08543 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Efna5O08543 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms