Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MsmbO08540 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MsmbO08540 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MsmbO08540 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MsmbO08540 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MsmbO08540 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MsmbO08540 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MsmbO08540 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MsmbO08540 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MsmbO08540 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MsmbO08540 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MsmbO08540 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MsmbO08540 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MsmbO08540 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MsmbO08540 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MsmbO08540 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MsmbO08540 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MsmbO08540 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MsmbO08540 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MsmbO08540 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
MsmbO08540 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MsmbO08540 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MsmbO08540 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MsmbO08540 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MsmbO08540 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MsmbO08540 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MsmbO08540 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MsmbO08540 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MsmbO08540 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MsmbO08540 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MsmbO08540 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MsmbO08540 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MsmbO08540 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MsmbO08540 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MsmbO08540 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MsmbO08540 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MsmbO08540 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MsmbO08540 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MsmbO08540 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MsmbO08540 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MsmbO08540 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MsmbO08540 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MsmbO08540 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MsmbO08540 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MsmbO08540 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MsmbO08540 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
MsmbO08540 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MsmbO08540 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MsmbO08540 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MsmbO08540 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MsmbO08540 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MsmbO08540 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MsmbO08540 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MsmbO08540 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MsmbO08540 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
MsmbO08540 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MsmbO08540 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MsmbO08540 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MsmbO08540 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MsmbO08540 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MsmbO08540 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MsmbO08540 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MsmbO08540 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
MsmbO08540 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MsmbO08540 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MsmbO08540 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
MsmbO08540 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MsmbO08540 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MsmbO08540 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
MsmbO08540 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MsmbO08540 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MsmbO08540 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
MsmbO08540 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MsmbO08540 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MsmbO08540 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MsmbO08540 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MsmbO08540 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MsmbO08540 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MsmbO08540 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MsmbO08540 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
MsmbO08540 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MsmbO08540 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MsmbO08540 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MsmbO08540 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MsmbO08540 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MsmbO08540 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MsmbO08540 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MsmbO08540 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MsmbO08540 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MsmbO08540 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MsmbO08540 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MsmbO08540 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
MsmbO08540 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MsmbO08540 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MsmbO08540 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MsmbO08540 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MsmbO08540 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MsmbO08540 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MsmbO08540 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MsmbO08540 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
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