Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U5

Vmn2r78, Vomeronasal 2, receptor 78, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r78K7N6U5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Vmn2r78K7N6U5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Vmn2r78K7N6U5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Vmn2r78K7N6U5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Vmn2r78K7N6U5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Vmn2r78K7N6U5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Vmn2r78K7N6U5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Vmn2r78K7N6U5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Vmn2r78K7N6U5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Vmn2r78K7N6U5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Vmn2r78K7N6U5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Vmn2r78K7N6U5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Vmn2r78K7N6U5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Vmn2r78K7N6U5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Vmn2r78K7N6U5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Vmn2r78K7N6U5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Vmn2r78K7N6U5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Vmn2r78K7N6U5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Vmn2r78K7N6U5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Vmn2r78K7N6U5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Vmn2r78K7N6U5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Vmn2r78K7N6U5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Vmn2r78K7N6U5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Vmn2r78K7N6U5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Vmn2r78K7N6U5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Vmn2r78K7N6U5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Vmn2r78K7N6U5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Vmn2r78K7N6U5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Vmn2r78K7N6U5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Vmn2r78K7N6U5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Vmn2r78K7N6U5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Vmn2r78K7N6U5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Vmn2r78K7N6U5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Vmn2r78K7N6U5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Vmn2r78K7N6U5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Vmn2r78K7N6U5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Vmn2r78K7N6U5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Vmn2r78K7N6U5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Vmn2r78K7N6U5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Vmn2r78K7N6U5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Vmn2r78K7N6U5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Vmn2r78K7N6U5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Vmn2r78K7N6U5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Vmn2r78K7N6U5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Vmn2r78K7N6U5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Vmn2r78K7N6U5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Vmn2r78K7N6U5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Vmn2r78K7N6U5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Vmn2r78K7N6U5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Vmn2r78K7N6U5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Vmn2r78K7N6U5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Vmn2r78K7N6U5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Vmn2r78K7N6U5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Vmn2r78K7N6U5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Vmn2r78K7N6U5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Vmn2r78K7N6U5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Vmn2r78K7N6U5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Vmn2r78K7N6U5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Vmn2r78K7N6U5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Vmn2r78K7N6U5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Vmn2r78K7N6U5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Vmn2r78K7N6U5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Vmn2r78K7N6U5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Vmn2r78K7N6U5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Vmn2r78K7N6U5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Vmn2r78K7N6U5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Vmn2r78K7N6U5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Vmn2r78K7N6U5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Vmn2r78K7N6U5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Vmn2r78K7N6U5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Vmn2r78K7N6U5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Vmn2r78K7N6U5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Vmn2r78K7N6U5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vmn2r78K7N6U5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vmn2r78K7N6U5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vmn2r78K7N6U5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vmn2r78K7N6U5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Vmn2r78K7N6U5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Vmn2r78K7N6U5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Vmn2r78K7N6U5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Vmn2r78K7N6U5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Vmn2r78K7N6U5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Vmn2r78K7N6U5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Vmn2r78K7N6U5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Vmn2r78K7N6U5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Vmn2r78K7N6U5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Vmn2r78K7N6U5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Vmn2r78K7N6U5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Vmn2r78K7N6U5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Vmn2r78K7N6U5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Vmn2r78K7N6U5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Vmn2r78K7N6U5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Vmn2r78K7N6U5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Vmn2r78K7N6U5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Vmn2r78K7N6U5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Vmn2r78K7N6U5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Vmn2r78K7N6U5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Vmn2r78K7N6U5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Vmn2r78K7N6U5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Vmn2r78K7N6U5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms