Protein–RNA interactions for Protein: J3QPZ4

Gm20877, MCG1032490, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20877J3QPZ4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm20877J3QPZ4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm20877J3QPZ4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm20877J3QPZ4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm20877J3QPZ4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm20877J3QPZ4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm20877J3QPZ4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm20877J3QPZ4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm20877J3QPZ4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Gm20877J3QPZ4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Gm20877J3QPZ4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm20877J3QPZ4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm20877J3QPZ4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm20877J3QPZ4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm20877J3QPZ4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm20877J3QPZ4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm20877J3QPZ4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm20877J3QPZ4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm20877J3QPZ4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm20877J3QPZ4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm20877J3QPZ4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm20877J3QPZ4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm20877J3QPZ4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm20877J3QPZ4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm20877J3QPZ4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm20877J3QPZ4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm20877J3QPZ4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm20877J3QPZ4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm20877J3QPZ4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm20877J3QPZ4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm20877J3QPZ4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm20877J3QPZ4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm20877J3QPZ4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm20877J3QPZ4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm20877J3QPZ4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm20877J3QPZ4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm20877J3QPZ4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm20877J3QPZ4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm20877J3QPZ4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm20877J3QPZ4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm20877J3QPZ4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm20877J3QPZ4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm20877J3QPZ4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm20877J3QPZ4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm20877J3QPZ4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm20877J3QPZ4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm20877J3QPZ4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm20877J3QPZ4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm20877J3QPZ4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm20877J3QPZ4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm20877J3QPZ4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm20877J3QPZ4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm20877J3QPZ4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm20877J3QPZ4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm20877J3QPZ4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm20877J3QPZ4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm20877J3QPZ4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm20877J3QPZ4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm20877J3QPZ4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm20877J3QPZ4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm20877J3QPZ4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm20877J3QPZ4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm20877J3QPZ4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm20877J3QPZ4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm20877J3QPZ4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm20877J3QPZ4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm20877J3QPZ4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm20877J3QPZ4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm20877J3QPZ4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm20877J3QPZ4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm20877J3QPZ4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm20877J3QPZ4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm20877J3QPZ4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm20877J3QPZ4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm20877J3QPZ4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm20877J3QPZ4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm20877J3QPZ4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm20877J3QPZ4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm20877J3QPZ4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm20877J3QPZ4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm20877J3QPZ4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm20877J3QPZ4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm20877J3QPZ4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm20877J3QPZ4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm20877J3QPZ4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm20877J3QPZ4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm20877J3QPZ4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm20877J3QPZ4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm20877J3QPZ4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm20877J3QPZ4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm20877J3QPZ4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm20877J3QPZ4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm20877J3QPZ4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm20877J3QPZ4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm20877J3QPZ4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm20877J3QPZ4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm20877J3QPZ4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm20877J3QPZ4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm20877J3QPZ4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm20877J3QPZ4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms