Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS2

1700014D04Rik, MCG148436, mousemouse

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700014D04RikJ3QMS2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
1700014D04RikJ3QMS2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
1700014D04RikJ3QMS2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
1700014D04RikJ3QMS2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
1700014D04RikJ3QMS2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
1700014D04RikJ3QMS2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
1700014D04RikJ3QMS2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
1700014D04RikJ3QMS2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
1700014D04RikJ3QMS2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
1700014D04RikJ3QMS2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
1700014D04RikJ3QMS2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
1700014D04RikJ3QMS2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
1700014D04RikJ3QMS2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
1700014D04RikJ3QMS2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
1700014D04RikJ3QMS2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
1700014D04RikJ3QMS2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
1700014D04RikJ3QMS2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
1700014D04RikJ3QMS2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
1700014D04RikJ3QMS2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
1700014D04RikJ3QMS2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
1700014D04RikJ3QMS2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
1700014D04RikJ3QMS2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
1700014D04RikJ3QMS2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
1700014D04RikJ3QMS2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
1700014D04RikJ3QMS2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
1700014D04RikJ3QMS2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
1700014D04RikJ3QMS2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
1700014D04RikJ3QMS2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
1700014D04RikJ3QMS2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
1700014D04RikJ3QMS2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
1700014D04RikJ3QMS2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
1700014D04RikJ3QMS2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
1700014D04RikJ3QMS2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
1700014D04RikJ3QMS2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
1700014D04RikJ3QMS2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
1700014D04RikJ3QMS2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
1700014D04RikJ3QMS2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
1700014D04RikJ3QMS2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
1700014D04RikJ3QMS2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
1700014D04RikJ3QMS2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
1700014D04RikJ3QMS2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
1700014D04RikJ3QMS2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
1700014D04RikJ3QMS2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
1700014D04RikJ3QMS2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
1700014D04RikJ3QMS2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
1700014D04RikJ3QMS2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
1700014D04RikJ3QMS2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
1700014D04RikJ3QMS2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
1700014D04RikJ3QMS2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
1700014D04RikJ3QMS2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
1700014D04RikJ3QMS2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
1700014D04RikJ3QMS2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
1700014D04RikJ3QMS2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
1700014D04RikJ3QMS2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
1700014D04RikJ3QMS2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
1700014D04RikJ3QMS2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
1700014D04RikJ3QMS2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
1700014D04RikJ3QMS2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
1700014D04RikJ3QMS2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
1700014D04RikJ3QMS2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
1700014D04RikJ3QMS2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
1700014D04RikJ3QMS2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
1700014D04RikJ3QMS2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
1700014D04RikJ3QMS2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
1700014D04RikJ3QMS2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
1700014D04RikJ3QMS2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
1700014D04RikJ3QMS2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
1700014D04RikJ3QMS2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
1700014D04RikJ3QMS2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
1700014D04RikJ3QMS2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
1700014D04RikJ3QMS2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
1700014D04RikJ3QMS2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
1700014D04RikJ3QMS2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
1700014D04RikJ3QMS2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
1700014D04RikJ3QMS2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
1700014D04RikJ3QMS2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
1700014D04RikJ3QMS2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
1700014D04RikJ3QMS2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
1700014D04RikJ3QMS2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
1700014D04RikJ3QMS2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
1700014D04RikJ3QMS2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
1700014D04RikJ3QMS2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
1700014D04RikJ3QMS2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
1700014D04RikJ3QMS2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
1700014D04RikJ3QMS2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
1700014D04RikJ3QMS2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
1700014D04RikJ3QMS2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
1700014D04RikJ3QMS2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
1700014D04RikJ3QMS2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
1700014D04RikJ3QMS2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
1700014D04RikJ3QMS2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
1700014D04RikJ3QMS2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
1700014D04RikJ3QMS2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
1700014D04RikJ3QMS2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
1700014D04RikJ3QMS2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
1700014D04RikJ3QMS2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
1700014D04RikJ3QMS2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
1700014D04RikJ3QMS2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
1700014D04RikJ3QMS2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
1700014D04RikJ3QMS2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.8 ms