Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm21060J3KMU4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm21060J3KMU4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm21060J3KMU4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm21060J3KMU4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm21060J3KMU4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm21060J3KMU4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm21060J3KMU4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm21060J3KMU4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm21060J3KMU4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm21060J3KMU4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm21060J3KMU4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm21060J3KMU4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm21060J3KMU4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm21060J3KMU4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm21060J3KMU4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm21060J3KMU4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm21060J3KMU4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm21060J3KMU4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm21060J3KMU4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm21060J3KMU4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm21060J3KMU4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm21060J3KMU4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm21060J3KMU4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm21060J3KMU4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm21060J3KMU4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm21060J3KMU4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm21060J3KMU4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm21060J3KMU4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm21060J3KMU4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm21060J3KMU4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm21060J3KMU4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm21060J3KMU4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm21060J3KMU4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm21060J3KMU4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm21060J3KMU4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm21060J3KMU4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm21060J3KMU4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm21060J3KMU4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm21060J3KMU4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm21060J3KMU4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm21060J3KMU4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm21060J3KMU4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm21060J3KMU4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm21060J3KMU4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm21060J3KMU4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm21060J3KMU4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm21060J3KMU4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm21060J3KMU4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm21060J3KMU4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm21060J3KMU4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm21060J3KMU4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm21060J3KMU4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm21060J3KMU4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm21060J3KMU4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm21060J3KMU4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm21060J3KMU4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm21060J3KMU4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm21060J3KMU4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm21060J3KMU4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm21060J3KMU4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm21060J3KMU4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm21060J3KMU4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm21060J3KMU4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm21060J3KMU4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm21060J3KMU4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm21060J3KMU4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm21060J3KMU4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm21060J3KMU4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm21060J3KMU4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm21060J3KMU4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm21060J3KMU4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm21060J3KMU4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm21060J3KMU4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm21060J3KMU4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm21060J3KMU4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm21060J3KMU4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm21060J3KMU4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm21060J3KMU4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm21060J3KMU4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm21060J3KMU4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm21060J3KMU4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm21060J3KMU4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm21060J3KMU4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm21060J3KMU4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm21060J3KMU4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm21060J3KMU4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm21060J3KMU4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm21060J3KMU4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm21060J3KMU4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm21060J3KMU4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm21060J3KMU4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm21060J3KMU4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm21060J3KMU4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm21060J3KMU4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm21060J3KMU4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm21060J3KMU4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm21060J3KMU4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm21060J3KMU4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm21060J3KMU4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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