Protein–RNA interactions for Protein: G3XA12

4933406M09Rik, RIKEN cDNA 4933406M09, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933406M09RikG3XA12 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
4933406M09RikG3XA12 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
4933406M09RikG3XA12 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
4933406M09RikG3XA12 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
4933406M09RikG3XA12 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
4933406M09RikG3XA12 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
4933406M09RikG3XA12 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
4933406M09RikG3XA12 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
4933406M09RikG3XA12 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
4933406M09RikG3XA12 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
4933406M09RikG3XA12 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
4933406M09RikG3XA12 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
4933406M09RikG3XA12 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
4933406M09RikG3XA12 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
4933406M09RikG3XA12 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
4933406M09RikG3XA12 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
4933406M09RikG3XA12 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
4933406M09RikG3XA12 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
4933406M09RikG3XA12 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
4933406M09RikG3XA12 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
4933406M09RikG3XA12 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
4933406M09RikG3XA12 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
4933406M09RikG3XA12 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
4933406M09RikG3XA12 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
4933406M09RikG3XA12 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
4933406M09RikG3XA12 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
4933406M09RikG3XA12 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
4933406M09RikG3XA12 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
4933406M09RikG3XA12 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
4933406M09RikG3XA12 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
4933406M09RikG3XA12 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
4933406M09RikG3XA12 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
4933406M09RikG3XA12 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
4933406M09RikG3XA12 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
4933406M09RikG3XA12 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
4933406M09RikG3XA12 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
4933406M09RikG3XA12 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
4933406M09RikG3XA12 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
4933406M09RikG3XA12 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
4933406M09RikG3XA12 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
4933406M09RikG3XA12 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
4933406M09RikG3XA12 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
4933406M09RikG3XA12 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
4933406M09RikG3XA12 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
4933406M09RikG3XA12 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
4933406M09RikG3XA12 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
4933406M09RikG3XA12 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
4933406M09RikG3XA12 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
4933406M09RikG3XA12 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
4933406M09RikG3XA12 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
4933406M09RikG3XA12 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
4933406M09RikG3XA12 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
4933406M09RikG3XA12 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
4933406M09RikG3XA12 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
4933406M09RikG3XA12 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
4933406M09RikG3XA12 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
4933406M09RikG3XA12 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
4933406M09RikG3XA12 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
4933406M09RikG3XA12 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
4933406M09RikG3XA12 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
4933406M09RikG3XA12 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
4933406M09RikG3XA12 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
4933406M09RikG3XA12 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
4933406M09RikG3XA12 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
4933406M09RikG3XA12 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
4933406M09RikG3XA12 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
4933406M09RikG3XA12 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
4933406M09RikG3XA12 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
4933406M09RikG3XA12 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
4933406M09RikG3XA12 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
4933406M09RikG3XA12 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
4933406M09RikG3XA12 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
4933406M09RikG3XA12 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
4933406M09RikG3XA12 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
4933406M09RikG3XA12 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
4933406M09RikG3XA12 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
4933406M09RikG3XA12 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
4933406M09RikG3XA12 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
4933406M09RikG3XA12 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
4933406M09RikG3XA12 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
4933406M09RikG3XA12 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
4933406M09RikG3XA12 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
4933406M09RikG3XA12 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
4933406M09RikG3XA12 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
4933406M09RikG3XA12 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
4933406M09RikG3XA12 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
4933406M09RikG3XA12 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
4933406M09RikG3XA12 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
4933406M09RikG3XA12 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
4933406M09RikG3XA12 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
4933406M09RikG3XA12 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
4933406M09RikG3XA12 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
4933406M09RikG3XA12 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
4933406M09RikG3XA12 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
4933406M09RikG3XA12 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
4933406M09RikG3XA12 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
4933406M09RikG3XA12 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
4933406M09RikG3XA12 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
4933406M09RikG3XA12 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
4933406M09RikG3XA12 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms