Protein–RNA interactions for Protein: G3X9D6

Apon, Apolipoprotein N, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AponG3X9D6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AponG3X9D6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AponG3X9D6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AponG3X9D6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AponG3X9D6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
AponG3X9D6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AponG3X9D6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AponG3X9D6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AponG3X9D6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AponG3X9D6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AponG3X9D6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
AponG3X9D6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AponG3X9D6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AponG3X9D6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AponG3X9D6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AponG3X9D6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AponG3X9D6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AponG3X9D6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AponG3X9D6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AponG3X9D6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AponG3X9D6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AponG3X9D6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AponG3X9D6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AponG3X9D6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AponG3X9D6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AponG3X9D6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AponG3X9D6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AponG3X9D6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
AponG3X9D6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
AponG3X9D6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AponG3X9D6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AponG3X9D6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AponG3X9D6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AponG3X9D6 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AponG3X9D6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
AponG3X9D6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AponG3X9D6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AponG3X9D6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AponG3X9D6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AponG3X9D6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AponG3X9D6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AponG3X9D6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AponG3X9D6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AponG3X9D6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AponG3X9D6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AponG3X9D6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AponG3X9D6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AponG3X9D6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AponG3X9D6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
AponG3X9D6 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AponG3X9D6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AponG3X9D6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
AponG3X9D6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AponG3X9D6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AponG3X9D6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AponG3X9D6 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
AponG3X9D6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AponG3X9D6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
AponG3X9D6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AponG3X9D6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
AponG3X9D6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
AponG3X9D6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
AponG3X9D6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
AponG3X9D6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
AponG3X9D6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
AponG3X9D6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AponG3X9D6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AponG3X9D6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AponG3X9D6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AponG3X9D6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AponG3X9D6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AponG3X9D6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AponG3X9D6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AponG3X9D6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AponG3X9D6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AponG3X9D6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
AponG3X9D6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AponG3X9D6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AponG3X9D6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AponG3X9D6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AponG3X9D6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AponG3X9D6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AponG3X9D6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AponG3X9D6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AponG3X9D6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AponG3X9D6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AponG3X9D6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AponG3X9D6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
AponG3X9D6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AponG3X9D6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AponG3X9D6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AponG3X9D6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AponG3X9D6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
AponG3X9D6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
AponG3X9D6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AponG3X9D6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
AponG3X9D6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
AponG3X9D6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AponG3X9D6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AponG3X9D6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms