Protein–RNA interactions for Protein: G3UVU6

Gm20517, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20517G3UVU6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20517G3UVU6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20517G3UVU6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20517G3UVU6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20517G3UVU6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20517G3UVU6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20517G3UVU6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20517G3UVU6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20517G3UVU6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20517G3UVU6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20517G3UVU6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20517G3UVU6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20517G3UVU6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20517G3UVU6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20517G3UVU6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20517G3UVU6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20517G3UVU6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20517G3UVU6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20517G3UVU6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20517G3UVU6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20517G3UVU6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20517G3UVU6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20517G3UVU6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20517G3UVU6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20517G3UVU6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20517G3UVU6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20517G3UVU6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20517G3UVU6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20517G3UVU6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20517G3UVU6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20517G3UVU6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20517G3UVU6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20517G3UVU6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20517G3UVU6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20517G3UVU6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20517G3UVU6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20517G3UVU6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm20517G3UVU6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm20517G3UVU6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm20517G3UVU6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm20517G3UVU6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm20517G3UVU6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm20517G3UVU6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20517G3UVU6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20517G3UVU6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20517G3UVU6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20517G3UVU6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20517G3UVU6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20517G3UVU6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20517G3UVU6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20517G3UVU6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20517G3UVU6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20517G3UVU6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20517G3UVU6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20517G3UVU6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20517G3UVU6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20517G3UVU6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20517G3UVU6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20517G3UVU6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20517G3UVU6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20517G3UVU6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20517G3UVU6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20517G3UVU6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20517G3UVU6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20517G3UVU6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20517G3UVU6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20517G3UVU6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20517G3UVU6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20517G3UVU6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm20517G3UVU6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20517G3UVU6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20517G3UVU6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20517G3UVU6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20517G3UVU6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20517G3UVU6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20517G3UVU6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20517G3UVU6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20517G3UVU6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20517G3UVU6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20517G3UVU6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20517G3UVU6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20517G3UVU6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20517G3UVU6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20517G3UVU6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20517G3UVU6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20517G3UVU6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20517G3UVU6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20517G3UVU6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20517G3UVU6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20517G3UVU6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20517G3UVU6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20517G3UVU6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20517G3UVU6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20517G3UVU6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20517G3UVU6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20517G3UVU6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20517G3UVU6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20517G3UVU6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20517G3UVU6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20517G3UVU6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 187.8 ms