Protein–RNA interactions for Protein: F6ZGR6

D430041D05Rik, RIKEN cDNA D430041D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D430041D05RikF6ZGR6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
D430041D05RikF6ZGR6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
D430041D05RikF6ZGR6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
D430041D05RikF6ZGR6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
D430041D05RikF6ZGR6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
D430041D05RikF6ZGR6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
D430041D05RikF6ZGR6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
D430041D05RikF6ZGR6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
D430041D05RikF6ZGR6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC32.4■■■□□ 2.78
D430041D05RikF6ZGR6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
D430041D05RikF6ZGR6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
D430041D05RikF6ZGR6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
D430041D05RikF6ZGR6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
D430041D05RikF6ZGR6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
D430041D05RikF6ZGR6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
D430041D05RikF6ZGR6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
D430041D05RikF6ZGR6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
D430041D05RikF6ZGR6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
D430041D05RikF6ZGR6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
D430041D05RikF6ZGR6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
D430041D05RikF6ZGR6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
D430041D05RikF6ZGR6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
D430041D05RikF6ZGR6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
D430041D05RikF6ZGR6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
D430041D05RikF6ZGR6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
D430041D05RikF6ZGR6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
D430041D05RikF6ZGR6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
D430041D05RikF6ZGR6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
D430041D05RikF6ZGR6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
D430041D05RikF6ZGR6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
D430041D05RikF6ZGR6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
D430041D05RikF6ZGR6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
D430041D05RikF6ZGR6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC32.28■■■□□ 2.76
D430041D05RikF6ZGR6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
D430041D05RikF6ZGR6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
D430041D05RikF6ZGR6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
D430041D05RikF6ZGR6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
D430041D05RikF6ZGR6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
D430041D05RikF6ZGR6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
D430041D05RikF6ZGR6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
D430041D05RikF6ZGR6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
D430041D05RikF6ZGR6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
D430041D05RikF6ZGR6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
D430041D05RikF6ZGR6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
D430041D05RikF6ZGR6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
D430041D05RikF6ZGR6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC32.22■■■□□ 2.75
D430041D05RikF6ZGR6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
D430041D05RikF6ZGR6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
D430041D05RikF6ZGR6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
D430041D05RikF6ZGR6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
D430041D05RikF6ZGR6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
D430041D05RikF6ZGR6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
D430041D05RikF6ZGR6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.74
D430041D05RikF6ZGR6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC32.2■■■□□ 2.74
D430041D05RikF6ZGR6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
D430041D05RikF6ZGR6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
D430041D05RikF6ZGR6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
D430041D05RikF6ZGR6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
D430041D05RikF6ZGR6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
D430041D05RikF6ZGR6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
D430041D05RikF6ZGR6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
D430041D05RikF6ZGR6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
D430041D05RikF6ZGR6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
D430041D05RikF6ZGR6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
D430041D05RikF6ZGR6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
D430041D05RikF6ZGR6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
D430041D05RikF6ZGR6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
D430041D05RikF6ZGR6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
D430041D05RikF6ZGR6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
D430041D05RikF6ZGR6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
D430041D05RikF6ZGR6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
D430041D05RikF6ZGR6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
D430041D05RikF6ZGR6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
D430041D05RikF6ZGR6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
D430041D05RikF6ZGR6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
D430041D05RikF6ZGR6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
D430041D05RikF6ZGR6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
D430041D05RikF6ZGR6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
D430041D05RikF6ZGR6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
D430041D05RikF6ZGR6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
D430041D05RikF6ZGR6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
D430041D05RikF6ZGR6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
D430041D05RikF6ZGR6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
D430041D05RikF6ZGR6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
D430041D05RikF6ZGR6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
D430041D05RikF6ZGR6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
D430041D05RikF6ZGR6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
D430041D05RikF6ZGR6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
D430041D05RikF6ZGR6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
D430041D05RikF6ZGR6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
D430041D05RikF6ZGR6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC32.04■■■□□ 2.72
D430041D05RikF6ZGR6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC32.04■■■□□ 2.72
D430041D05RikF6ZGR6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
D430041D05RikF6ZGR6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
D430041D05RikF6ZGR6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
D430041D05RikF6ZGR6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
D430041D05RikF6ZGR6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
D430041D05RikF6ZGR6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
D430041D05RikF6ZGR6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
D430041D05RikF6ZGR6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms