Protein–RNA interactions for Protein: F6VLK5

Gm10722, Predicted gene 10722, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10722F6VLK5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm10722F6VLK5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm10722F6VLK5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm10722F6VLK5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm10722F6VLK5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm10722F6VLK5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm10722F6VLK5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm10722F6VLK5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm10722F6VLK5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm10722F6VLK5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm10722F6VLK5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm10722F6VLK5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm10722F6VLK5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm10722F6VLK5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm10722F6VLK5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm10722F6VLK5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm10722F6VLK5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm10722F6VLK5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm10722F6VLK5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm10722F6VLK5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gm10722F6VLK5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gm10722F6VLK5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gm10722F6VLK5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm10722F6VLK5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm10722F6VLK5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm10722F6VLK5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm10722F6VLK5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm10722F6VLK5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm10722F6VLK5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm10722F6VLK5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm10722F6VLK5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm10722F6VLK5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm10722F6VLK5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm10722F6VLK5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm10722F6VLK5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm10722F6VLK5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm10722F6VLK5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm10722F6VLK5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm10722F6VLK5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm10722F6VLK5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gm10722F6VLK5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm10722F6VLK5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm10722F6VLK5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm10722F6VLK5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm10722F6VLK5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm10722F6VLK5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm10722F6VLK5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm10722F6VLK5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm10722F6VLK5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm10722F6VLK5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm10722F6VLK5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm10722F6VLK5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm10722F6VLK5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm10722F6VLK5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm10722F6VLK5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm10722F6VLK5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm10722F6VLK5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm10722F6VLK5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm10722F6VLK5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm10722F6VLK5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm10722F6VLK5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm10722F6VLK5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm10722F6VLK5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm10722F6VLK5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm10722F6VLK5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm10722F6VLK5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm10722F6VLK5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm10722F6VLK5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm10722F6VLK5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm10722F6VLK5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm10722F6VLK5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm10722F6VLK5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm10722F6VLK5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm10722F6VLK5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm10722F6VLK5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm10722F6VLK5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm10722F6VLK5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm10722F6VLK5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm10722F6VLK5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm10722F6VLK5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm10722F6VLK5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm10722F6VLK5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm10722F6VLK5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm10722F6VLK5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm10722F6VLK5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm10722F6VLK5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm10722F6VLK5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm10722F6VLK5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm10722F6VLK5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm10722F6VLK5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm10722F6VLK5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm10722F6VLK5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm10722F6VLK5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm10722F6VLK5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm10722F6VLK5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm10722F6VLK5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm10722F6VLK5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm10722F6VLK5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm10722F6VLK5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm10722F6VLK5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.1 ms