Protein–RNA interactions for Protein: E9QAB6

Ptar1, Protein prenyltransferase alpha subunit repeat-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptar1E9QAB6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ptar1E9QAB6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ptar1E9QAB6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ptar1E9QAB6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ptar1E9QAB6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ptar1E9QAB6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ptar1E9QAB6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ptar1E9QAB6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ptar1E9QAB6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ptar1E9QAB6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ptar1E9QAB6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ptar1E9QAB6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ptar1E9QAB6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ptar1E9QAB6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ptar1E9QAB6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ptar1E9QAB6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ptar1E9QAB6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ptar1E9QAB6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ptar1E9QAB6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ptar1E9QAB6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ptar1E9QAB6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ptar1E9QAB6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ptar1E9QAB6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ptar1E9QAB6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ptar1E9QAB6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ptar1E9QAB6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ptar1E9QAB6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ptar1E9QAB6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ptar1E9QAB6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ptar1E9QAB6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ptar1E9QAB6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ptar1E9QAB6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ptar1E9QAB6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ptar1E9QAB6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ptar1E9QAB6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ptar1E9QAB6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ptar1E9QAB6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ptar1E9QAB6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ptar1E9QAB6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ptar1E9QAB6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ptar1E9QAB6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ptar1E9QAB6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ptar1E9QAB6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ptar1E9QAB6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ptar1E9QAB6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ptar1E9QAB6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ptar1E9QAB6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ptar1E9QAB6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ptar1E9QAB6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ptar1E9QAB6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ptar1E9QAB6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ptar1E9QAB6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ptar1E9QAB6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ptar1E9QAB6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ptar1E9QAB6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ptar1E9QAB6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ptar1E9QAB6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ptar1E9QAB6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ptar1E9QAB6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ptar1E9QAB6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ptar1E9QAB6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ptar1E9QAB6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ptar1E9QAB6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ptar1E9QAB6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ptar1E9QAB6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ptar1E9QAB6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ptar1E9QAB6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ptar1E9QAB6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ptar1E9QAB6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ptar1E9QAB6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ptar1E9QAB6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ptar1E9QAB6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ptar1E9QAB6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ptar1E9QAB6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ptar1E9QAB6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ptar1E9QAB6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ptar1E9QAB6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ptar1E9QAB6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ptar1E9QAB6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ptar1E9QAB6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ptar1E9QAB6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ptar1E9QAB6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ptar1E9QAB6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ptar1E9QAB6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ptar1E9QAB6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ptar1E9QAB6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ptar1E9QAB6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ptar1E9QAB6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ptar1E9QAB6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ptar1E9QAB6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ptar1E9QAB6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ptar1E9QAB6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ptar1E9QAB6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ptar1E9QAB6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ptar1E9QAB6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ptar1E9QAB6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ptar1E9QAB6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ptar1E9QAB6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ptar1E9QAB6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ptar1E9QAB6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms