Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5R7

Nlrp12, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp12E9Q5R7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nlrp12E9Q5R7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Nlrp12E9Q5R7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nlrp12E9Q5R7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nlrp12E9Q5R7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nlrp12E9Q5R7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Nlrp12E9Q5R7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nlrp12E9Q5R7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nlrp12E9Q5R7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nlrp12E9Q5R7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nlrp12E9Q5R7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nlrp12E9Q5R7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nlrp12E9Q5R7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nlrp12E9Q5R7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nlrp12E9Q5R7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Nlrp12E9Q5R7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nlrp12E9Q5R7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nlrp12E9Q5R7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nlrp12E9Q5R7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nlrp12E9Q5R7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nlrp12E9Q5R7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nlrp12E9Q5R7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nlrp12E9Q5R7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Nlrp12E9Q5R7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nlrp12E9Q5R7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Nlrp12E9Q5R7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nlrp12E9Q5R7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nlrp12E9Q5R7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nlrp12E9Q5R7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nlrp12E9Q5R7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Nlrp12E9Q5R7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nlrp12E9Q5R7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nlrp12E9Q5R7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nlrp12E9Q5R7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nlrp12E9Q5R7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nlrp12E9Q5R7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nlrp12E9Q5R7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nlrp12E9Q5R7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nlrp12E9Q5R7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nlrp12E9Q5R7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Nlrp12E9Q5R7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nlrp12E9Q5R7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nlrp12E9Q5R7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nlrp12E9Q5R7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nlrp12E9Q5R7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nlrp12E9Q5R7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nlrp12E9Q5R7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nlrp12E9Q5R7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nlrp12E9Q5R7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nlrp12E9Q5R7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nlrp12E9Q5R7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nlrp12E9Q5R7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nlrp12E9Q5R7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nlrp12E9Q5R7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nlrp12E9Q5R7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nlrp12E9Q5R7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nlrp12E9Q5R7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nlrp12E9Q5R7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nlrp12E9Q5R7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nlrp12E9Q5R7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nlrp12E9Q5R7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nlrp12E9Q5R7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nlrp12E9Q5R7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nlrp12E9Q5R7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nlrp12E9Q5R7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nlrp12E9Q5R7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nlrp12E9Q5R7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nlrp12E9Q5R7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nlrp12E9Q5R7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nlrp12E9Q5R7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nlrp12E9Q5R7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Nlrp12E9Q5R7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nlrp12E9Q5R7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nlrp12E9Q5R7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Nlrp12E9Q5R7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nlrp12E9Q5R7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nlrp12E9Q5R7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nlrp12E9Q5R7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlrp12E9Q5R7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlrp12E9Q5R7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlrp12E9Q5R7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlrp12E9Q5R7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlrp12E9Q5R7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlrp12E9Q5R7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nlrp12E9Q5R7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nlrp12E9Q5R7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nlrp12E9Q5R7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nlrp12E9Q5R7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nlrp12E9Q5R7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nlrp12E9Q5R7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nlrp12E9Q5R7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Nlrp12E9Q5R7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nlrp12E9Q5R7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nlrp12E9Q5R7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nlrp12E9Q5R7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nlrp12E9Q5R7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nlrp12E9Q5R7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nlrp12E9Q5R7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nlrp12E9Q5R7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nlrp12E9Q5R7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.6 ms