Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc71lE9Q4T4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc71lE9Q4T4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc71lE9Q4T4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc71lE9Q4T4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc71lE9Q4T4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc71lE9Q4T4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc71lE9Q4T4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc71lE9Q4T4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc71lE9Q4T4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc71lE9Q4T4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc71lE9Q4T4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc71lE9Q4T4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc71lE9Q4T4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc71lE9Q4T4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc71lE9Q4T4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc71lE9Q4T4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc71lE9Q4T4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc71lE9Q4T4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc71lE9Q4T4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc71lE9Q4T4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc71lE9Q4T4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc71lE9Q4T4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc71lE9Q4T4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc71lE9Q4T4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc71lE9Q4T4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc71lE9Q4T4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc71lE9Q4T4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc71lE9Q4T4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc71lE9Q4T4 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc71lE9Q4T4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc71lE9Q4T4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc71lE9Q4T4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc71lE9Q4T4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc71lE9Q4T4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms