Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1Z0

Krt90, Keratin 90, mousemouse

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt90E9Q1Z0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt90E9Q1Z0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt90E9Q1Z0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt90E9Q1Z0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt90E9Q1Z0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt90E9Q1Z0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt90E9Q1Z0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt90E9Q1Z0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt90E9Q1Z0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt90E9Q1Z0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt90E9Q1Z0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt90E9Q1Z0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt90E9Q1Z0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt90E9Q1Z0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt90E9Q1Z0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt90E9Q1Z0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt90E9Q1Z0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt90E9Q1Z0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt90E9Q1Z0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt90E9Q1Z0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt90E9Q1Z0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt90E9Q1Z0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt90E9Q1Z0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt90E9Q1Z0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt90E9Q1Z0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt90E9Q1Z0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt90E9Q1Z0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt90E9Q1Z0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt90E9Q1Z0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt90E9Q1Z0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Krt90E9Q1Z0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Krt90E9Q1Z0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krt90E9Q1Z0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krt90E9Q1Z0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krt90E9Q1Z0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Krt90E9Q1Z0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Krt90E9Q1Z0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Krt90E9Q1Z0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Krt90E9Q1Z0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Krt90E9Q1Z0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Krt90E9Q1Z0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Krt90E9Q1Z0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt90E9Q1Z0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt90E9Q1Z0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt90E9Q1Z0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt90E9Q1Z0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt90E9Q1Z0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt90E9Q1Z0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt90E9Q1Z0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt90E9Q1Z0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt90E9Q1Z0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt90E9Q1Z0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt90E9Q1Z0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt90E9Q1Z0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt90E9Q1Z0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt90E9Q1Z0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt90E9Q1Z0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt90E9Q1Z0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt90E9Q1Z0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt90E9Q1Z0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt90E9Q1Z0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt90E9Q1Z0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt90E9Q1Z0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt90E9Q1Z0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt90E9Q1Z0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt90E9Q1Z0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt90E9Q1Z0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt90E9Q1Z0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt90E9Q1Z0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt90E9Q1Z0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt90E9Q1Z0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt90E9Q1Z0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt90E9Q1Z0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt90E9Q1Z0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt90E9Q1Z0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt90E9Q1Z0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt90E9Q1Z0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt90E9Q1Z0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt90E9Q1Z0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt90E9Q1Z0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt90E9Q1Z0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt90E9Q1Z0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt90E9Q1Z0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt90E9Q1Z0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt90E9Q1Z0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt90E9Q1Z0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt90E9Q1Z0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt90E9Q1Z0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt90E9Q1Z0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt90E9Q1Z0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt90E9Q1Z0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt90E9Q1Z0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt90E9Q1Z0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt90E9Q1Z0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt90E9Q1Z0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Krt90E9Q1Z0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt90E9Q1Z0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt90E9Q1Z0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt90E9Q1Z0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt90E9Q1Z0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms