Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Brd1E9PZ26 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Brd1E9PZ26 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Brd1E9PZ26 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Brd1E9PZ26 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Brd1E9PZ26 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Brd1E9PZ26 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Brd1E9PZ26 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Brd1E9PZ26 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Brd1E9PZ26 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Brd1E9PZ26 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Brd1E9PZ26 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Brd1E9PZ26 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Brd1E9PZ26 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Brd1E9PZ26 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Brd1E9PZ26 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Brd1E9PZ26 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Brd1E9PZ26 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Brd1E9PZ26 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Brd1E9PZ26 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Brd1E9PZ26 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Brd1E9PZ26 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Brd1E9PZ26 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Brd1E9PZ26 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Brd1E9PZ26 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Brd1E9PZ26 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Brd1E9PZ26 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Brd1E9PZ26 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Brd1E9PZ26 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Brd1E9PZ26 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Brd1E9PZ26 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Brd1E9PZ26 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Brd1E9PZ26 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Brd1E9PZ26 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Brd1E9PZ26 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Brd1E9PZ26 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Brd1E9PZ26 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Brd1E9PZ26 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Brd1E9PZ26 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Brd1E9PZ26 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Brd1E9PZ26 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Brd1E9PZ26 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Brd1E9PZ26 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Brd1E9PZ26 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Brd1E9PZ26 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Brd1E9PZ26 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Brd1E9PZ26 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Brd1E9PZ26 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Brd1E9PZ26 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Brd1E9PZ26 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Brd1E9PZ26 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Brd1E9PZ26 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Brd1E9PZ26 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Brd1E9PZ26 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Brd1E9PZ26 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Brd1E9PZ26 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Brd1E9PZ26 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Brd1E9PZ26 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Brd1E9PZ26 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Brd1E9PZ26 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Brd1E9PZ26 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Brd1E9PZ26 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Brd1E9PZ26 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Brd1E9PZ26 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Brd1E9PZ26 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Brd1E9PZ26 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Brd1E9PZ26 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Brd1E9PZ26 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Brd1E9PZ26 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Brd1E9PZ26 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Brd1E9PZ26 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Brd1E9PZ26 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Brd1E9PZ26 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Brd1E9PZ26 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Brd1E9PZ26 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Brd1E9PZ26 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Brd1E9PZ26 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Brd1E9PZ26 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Brd1E9PZ26 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Brd1E9PZ26 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Brd1E9PZ26 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Brd1E9PZ26 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Brd1E9PZ26 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Brd1E9PZ26 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Brd1E9PZ26 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Brd1E9PZ26 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Brd1E9PZ26 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Brd1E9PZ26 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Brd1E9PZ26 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Brd1E9PZ26 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Brd1E9PZ26 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Brd1E9PZ26 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Brd1E9PZ26 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Brd1E9PZ26 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Brd1E9PZ26 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Brd1E9PZ26 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Brd1E9PZ26 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Brd1E9PZ26 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Brd1E9PZ26 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Brd1E9PZ26 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms