Protein–RNA interactions for Protein: E9PV24

Fga, Fibrinogen alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgaE9PV24 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FgaE9PV24 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FgaE9PV24 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FgaE9PV24 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FgaE9PV24 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FgaE9PV24 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FgaE9PV24 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FgaE9PV24 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FgaE9PV24 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FgaE9PV24 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FgaE9PV24 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FgaE9PV24 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FgaE9PV24 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FgaE9PV24 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FgaE9PV24 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FgaE9PV24 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FgaE9PV24 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FgaE9PV24 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FgaE9PV24 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FgaE9PV24 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FgaE9PV24 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FgaE9PV24 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FgaE9PV24 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FgaE9PV24 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FgaE9PV24 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FgaE9PV24 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FgaE9PV24 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FgaE9PV24 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FgaE9PV24 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FgaE9PV24 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FgaE9PV24 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FgaE9PV24 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FgaE9PV24 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FgaE9PV24 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FgaE9PV24 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FgaE9PV24 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FgaE9PV24 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FgaE9PV24 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FgaE9PV24 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FgaE9PV24 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FgaE9PV24 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FgaE9PV24 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FgaE9PV24 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FgaE9PV24 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FgaE9PV24 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FgaE9PV24 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FgaE9PV24 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FgaE9PV24 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FgaE9PV24 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FgaE9PV24 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FgaE9PV24 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FgaE9PV24 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FgaE9PV24 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FgaE9PV24 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FgaE9PV24 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FgaE9PV24 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FgaE9PV24 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FgaE9PV24 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FgaE9PV24 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FgaE9PV24 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FgaE9PV24 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FgaE9PV24 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FgaE9PV24 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FgaE9PV24 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FgaE9PV24 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FgaE9PV24 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FgaE9PV24 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FgaE9PV24 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FgaE9PV24 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FgaE9PV24 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FgaE9PV24 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FgaE9PV24 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FgaE9PV24 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FgaE9PV24 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FgaE9PV24 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FgaE9PV24 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FgaE9PV24 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FgaE9PV24 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FgaE9PV24 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FgaE9PV24 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FgaE9PV24 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FgaE9PV24 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FgaE9PV24 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FgaE9PV24 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FgaE9PV24 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FgaE9PV24 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FgaE9PV24 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FgaE9PV24 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FgaE9PV24 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FgaE9PV24 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FgaE9PV24 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FgaE9PV24 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FgaE9PV24 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FgaE9PV24 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FgaE9PV24 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FgaE9PV24 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FgaE9PV24 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FgaE9PV24 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FgaE9PV24 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FgaE9PV24 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms