Protein–RNA interactions for Protein: E9PUZ0

Apol11b, Apolipoprotein L 11b, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol11bE9PUZ0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Apol11bE9PUZ0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Apol11bE9PUZ0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Apol11bE9PUZ0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Apol11bE9PUZ0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Apol11bE9PUZ0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Apol11bE9PUZ0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Apol11bE9PUZ0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Apol11bE9PUZ0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Apol11bE9PUZ0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Apol11bE9PUZ0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Apol11bE9PUZ0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Apol11bE9PUZ0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Apol11bE9PUZ0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Apol11bE9PUZ0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Apol11bE9PUZ0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Apol11bE9PUZ0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Apol11bE9PUZ0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Apol11bE9PUZ0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Apol11bE9PUZ0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Apol11bE9PUZ0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Apol11bE9PUZ0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Apol11bE9PUZ0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Apol11bE9PUZ0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Apol11bE9PUZ0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Apol11bE9PUZ0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Apol11bE9PUZ0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Apol11bE9PUZ0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Apol11bE9PUZ0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Apol11bE9PUZ0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Apol11bE9PUZ0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Apol11bE9PUZ0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Apol11bE9PUZ0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Apol11bE9PUZ0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Apol11bE9PUZ0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Apol11bE9PUZ0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Apol11bE9PUZ0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Apol11bE9PUZ0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Apol11bE9PUZ0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Apol11bE9PUZ0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Apol11bE9PUZ0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Apol11bE9PUZ0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Apol11bE9PUZ0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Apol11bE9PUZ0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Apol11bE9PUZ0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Apol11bE9PUZ0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Apol11bE9PUZ0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Apol11bE9PUZ0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Apol11bE9PUZ0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Apol11bE9PUZ0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Apol11bE9PUZ0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Apol11bE9PUZ0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Apol11bE9PUZ0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Apol11bE9PUZ0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Apol11bE9PUZ0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Apol11bE9PUZ0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Apol11bE9PUZ0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Apol11bE9PUZ0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Apol11bE9PUZ0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Apol11bE9PUZ0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Apol11bE9PUZ0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Apol11bE9PUZ0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Apol11bE9PUZ0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Apol11bE9PUZ0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Apol11bE9PUZ0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Apol11bE9PUZ0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Apol11bE9PUZ0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Apol11bE9PUZ0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Apol11bE9PUZ0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Apol11bE9PUZ0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Apol11bE9PUZ0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Apol11bE9PUZ0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Apol11bE9PUZ0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Apol11bE9PUZ0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Apol11bE9PUZ0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Apol11bE9PUZ0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Apol11bE9PUZ0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Apol11bE9PUZ0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Apol11bE9PUZ0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Apol11bE9PUZ0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Apol11bE9PUZ0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Apol11bE9PUZ0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Apol11bE9PUZ0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Apol11bE9PUZ0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Apol11bE9PUZ0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Apol11bE9PUZ0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Apol11bE9PUZ0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Apol11bE9PUZ0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Apol11bE9PUZ0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Apol11bE9PUZ0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Apol11bE9PUZ0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Apol11bE9PUZ0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Apol11bE9PUZ0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Apol11bE9PUZ0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Apol11bE9PUZ0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Apol11bE9PUZ0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Apol11bE9PUZ0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Apol11bE9PUZ0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Apol11bE9PUZ0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Apol11bE9PUZ0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms