Protein–RNA interactions for Protein: E0CZ26

Kctd18, Potassium channel tetramerisation domain containing 18, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kctd18E0CZ26 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Kctd18E0CZ26 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Kctd18E0CZ26 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Kctd18E0CZ26 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Kctd18E0CZ26 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Kctd18E0CZ26 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kctd18E0CZ26 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kctd18E0CZ26 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kctd18E0CZ26 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kctd18E0CZ26 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Kctd18E0CZ26 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Kctd18E0CZ26 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Kctd18E0CZ26 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Kctd18E0CZ26 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Kctd18E0CZ26 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Kctd18E0CZ26 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Kctd18E0CZ26 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Kctd18E0CZ26 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Kctd18E0CZ26 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Kctd18E0CZ26 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Kctd18E0CZ26 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Kctd18E0CZ26 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Kctd18E0CZ26 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Kctd18E0CZ26 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Kctd18E0CZ26 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Kctd18E0CZ26 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Kctd18E0CZ26 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Kctd18E0CZ26 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Kctd18E0CZ26 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Kctd18E0CZ26 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Kctd18E0CZ26 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kctd18E0CZ26 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kctd18E0CZ26 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kctd18E0CZ26 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Kctd18E0CZ26 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kctd18E0CZ26 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kctd18E0CZ26 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kctd18E0CZ26 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kctd18E0CZ26 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kctd18E0CZ26 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kctd18E0CZ26 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kctd18E0CZ26 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kctd18E0CZ26 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Kctd18E0CZ26 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Kctd18E0CZ26 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Kctd18E0CZ26 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Kctd18E0CZ26 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Kctd18E0CZ26 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Kctd18E0CZ26 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Kctd18E0CZ26 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Kctd18E0CZ26 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kctd18E0CZ26 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kctd18E0CZ26 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Kctd18E0CZ26 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Kctd18E0CZ26 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kctd18E0CZ26 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Kctd18E0CZ26 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kctd18E0CZ26 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kctd18E0CZ26 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kctd18E0CZ26 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kctd18E0CZ26 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Kctd18E0CZ26 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Kctd18E0CZ26 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Kctd18E0CZ26 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Kctd18E0CZ26 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Kctd18E0CZ26 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Kctd18E0CZ26 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Kctd18E0CZ26 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kctd18E0CZ26 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kctd18E0CZ26 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kctd18E0CZ26 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kctd18E0CZ26 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kctd18E0CZ26 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kctd18E0CZ26 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kctd18E0CZ26 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kctd18E0CZ26 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Kctd18E0CZ26 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Kctd18E0CZ26 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Kctd18E0CZ26 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Kctd18E0CZ26 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kctd18E0CZ26 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kctd18E0CZ26 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kctd18E0CZ26 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Kctd18E0CZ26 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kctd18E0CZ26 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kctd18E0CZ26 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kctd18E0CZ26 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kctd18E0CZ26 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kctd18E0CZ26 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kctd18E0CZ26 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kctd18E0CZ26 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kctd18E0CZ26 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kctd18E0CZ26 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kctd18E0CZ26 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kctd18E0CZ26 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kctd18E0CZ26 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Kctd18E0CZ26 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Kctd18E0CZ26 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kctd18E0CZ26 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Kctd18E0CZ26 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms