Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3U4

9630041A04Rik, RIKEN cDNA 9630041A04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9630041A04RikD3Z3U4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
9630041A04RikD3Z3U4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
9630041A04RikD3Z3U4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
9630041A04RikD3Z3U4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
9630041A04RikD3Z3U4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
9630041A04RikD3Z3U4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
9630041A04RikD3Z3U4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
9630041A04RikD3Z3U4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
9630041A04RikD3Z3U4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
9630041A04RikD3Z3U4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
9630041A04RikD3Z3U4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
9630041A04RikD3Z3U4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
9630041A04RikD3Z3U4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
9630041A04RikD3Z3U4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
9630041A04RikD3Z3U4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
9630041A04RikD3Z3U4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
9630041A04RikD3Z3U4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
9630041A04RikD3Z3U4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
9630041A04RikD3Z3U4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
9630041A04RikD3Z3U4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
9630041A04RikD3Z3U4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
9630041A04RikD3Z3U4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
9630041A04RikD3Z3U4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
9630041A04RikD3Z3U4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
9630041A04RikD3Z3U4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
9630041A04RikD3Z3U4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
9630041A04RikD3Z3U4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
9630041A04RikD3Z3U4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
9630041A04RikD3Z3U4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
9630041A04RikD3Z3U4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
9630041A04RikD3Z3U4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
9630041A04RikD3Z3U4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
9630041A04RikD3Z3U4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
9630041A04RikD3Z3U4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
9630041A04RikD3Z3U4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
9630041A04RikD3Z3U4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
9630041A04RikD3Z3U4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
9630041A04RikD3Z3U4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
9630041A04RikD3Z3U4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
9630041A04RikD3Z3U4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
9630041A04RikD3Z3U4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
9630041A04RikD3Z3U4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
9630041A04RikD3Z3U4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
9630041A04RikD3Z3U4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
9630041A04RikD3Z3U4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
9630041A04RikD3Z3U4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
9630041A04RikD3Z3U4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
9630041A04RikD3Z3U4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
9630041A04RikD3Z3U4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
9630041A04RikD3Z3U4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
9630041A04RikD3Z3U4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
9630041A04RikD3Z3U4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
9630041A04RikD3Z3U4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
9630041A04RikD3Z3U4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
9630041A04RikD3Z3U4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23■■□□□ 1.27
9630041A04RikD3Z3U4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
9630041A04RikD3Z3U4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
9630041A04RikD3Z3U4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
9630041A04RikD3Z3U4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
9630041A04RikD3Z3U4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
9630041A04RikD3Z3U4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
9630041A04RikD3Z3U4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
9630041A04RikD3Z3U4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
9630041A04RikD3Z3U4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
9630041A04RikD3Z3U4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
9630041A04RikD3Z3U4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
9630041A04RikD3Z3U4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
9630041A04RikD3Z3U4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
9630041A04RikD3Z3U4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
9630041A04RikD3Z3U4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
9630041A04RikD3Z3U4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
9630041A04RikD3Z3U4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
9630041A04RikD3Z3U4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
9630041A04RikD3Z3U4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
9630041A04RikD3Z3U4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
9630041A04RikD3Z3U4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
9630041A04RikD3Z3U4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
9630041A04RikD3Z3U4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
9630041A04RikD3Z3U4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
9630041A04RikD3Z3U4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
9630041A04RikD3Z3U4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
9630041A04RikD3Z3U4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
9630041A04RikD3Z3U4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
9630041A04RikD3Z3U4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
9630041A04RikD3Z3U4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
9630041A04RikD3Z3U4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
9630041A04RikD3Z3U4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
9630041A04RikD3Z3U4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
9630041A04RikD3Z3U4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
9630041A04RikD3Z3U4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
9630041A04RikD3Z3U4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
9630041A04RikD3Z3U4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
9630041A04RikD3Z3U4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
9630041A04RikD3Z3U4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
9630041A04RikD3Z3U4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
9630041A04RikD3Z3U4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
9630041A04RikD3Z3U4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
9630041A04RikD3Z3U4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
9630041A04RikD3Z3U4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
9630041A04RikD3Z3U4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms