Protein–RNA interactions for Protein: D3Z0W7

Gm4871, MCG126741, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4871D3Z0W7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm4871D3Z0W7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm4871D3Z0W7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm4871D3Z0W7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm4871D3Z0W7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm4871D3Z0W7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm4871D3Z0W7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm4871D3Z0W7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm4871D3Z0W7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm4871D3Z0W7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm4871D3Z0W7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm4871D3Z0W7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm4871D3Z0W7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm4871D3Z0W7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm4871D3Z0W7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm4871D3Z0W7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm4871D3Z0W7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm4871D3Z0W7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm4871D3Z0W7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm4871D3Z0W7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm4871D3Z0W7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm4871D3Z0W7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm4871D3Z0W7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm4871D3Z0W7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm4871D3Z0W7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm4871D3Z0W7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm4871D3Z0W7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm4871D3Z0W7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm4871D3Z0W7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm4871D3Z0W7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm4871D3Z0W7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm4871D3Z0W7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm4871D3Z0W7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm4871D3Z0W7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm4871D3Z0W7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm4871D3Z0W7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm4871D3Z0W7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm4871D3Z0W7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm4871D3Z0W7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm4871D3Z0W7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm4871D3Z0W7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm4871D3Z0W7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm4871D3Z0W7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm4871D3Z0W7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm4871D3Z0W7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm4871D3Z0W7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm4871D3Z0W7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm4871D3Z0W7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm4871D3Z0W7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm4871D3Z0W7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm4871D3Z0W7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm4871D3Z0W7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm4871D3Z0W7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm4871D3Z0W7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm4871D3Z0W7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm4871D3Z0W7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm4871D3Z0W7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm4871D3Z0W7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm4871D3Z0W7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm4871D3Z0W7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm4871D3Z0W7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm4871D3Z0W7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm4871D3Z0W7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm4871D3Z0W7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm4871D3Z0W7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm4871D3Z0W7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm4871D3Z0W7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm4871D3Z0W7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm4871D3Z0W7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm4871D3Z0W7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm4871D3Z0W7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm4871D3Z0W7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm4871D3Z0W7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm4871D3Z0W7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm4871D3Z0W7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm4871D3Z0W7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm4871D3Z0W7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm4871D3Z0W7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm4871D3Z0W7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm4871D3Z0W7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm4871D3Z0W7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm4871D3Z0W7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm4871D3Z0W7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm4871D3Z0W7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm4871D3Z0W7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm4871D3Z0W7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm4871D3Z0W7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm4871D3Z0W7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm4871D3Z0W7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm4871D3Z0W7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm4871D3Z0W7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm4871D3Z0W7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm4871D3Z0W7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm4871D3Z0W7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm4871D3Z0W7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm4871D3Z0W7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm4871D3Z0W7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm4871D3Z0W7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm4871D3Z0W7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm4871D3Z0W7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms