Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rd3lB2RV38 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rd3lB2RV38 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rd3lB2RV38 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rd3lB2RV38 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rd3lB2RV38 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rd3lB2RV38 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rd3lB2RV38 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rd3lB2RV38 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rd3lB2RV38 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rd3lB2RV38 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rd3lB2RV38 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rd3lB2RV38 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rd3lB2RV38 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rd3lB2RV38 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rd3lB2RV38 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rd3lB2RV38 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rd3lB2RV38 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rd3lB2RV38 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rd3lB2RV38 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rd3lB2RV38 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rd3lB2RV38 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rd3lB2RV38 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rd3lB2RV38 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rd3lB2RV38 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rd3lB2RV38 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rd3lB2RV38 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rd3lB2RV38 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rd3lB2RV38 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rd3lB2RV38 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rd3lB2RV38 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rd3lB2RV38 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rd3lB2RV38 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rd3lB2RV38 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rd3lB2RV38 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rd3lB2RV38 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rd3lB2RV38 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rd3lB2RV38 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rd3lB2RV38 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Rd3lB2RV38 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rd3lB2RV38 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rd3lB2RV38 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rd3lB2RV38 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rd3lB2RV38 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rd3lB2RV38 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rd3lB2RV38 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rd3lB2RV38 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rd3lB2RV38 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rd3lB2RV38 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rd3lB2RV38 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rd3lB2RV38 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rd3lB2RV38 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rd3lB2RV38 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rd3lB2RV38 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rd3lB2RV38 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rd3lB2RV38 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rd3lB2RV38 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rd3lB2RV38 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rd3lB2RV38 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rd3lB2RV38 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rd3lB2RV38 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rd3lB2RV38 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rd3lB2RV38 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rd3lB2RV38 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rd3lB2RV38 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rd3lB2RV38 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rd3lB2RV38 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rd3lB2RV38 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rd3lB2RV38 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rd3lB2RV38 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rd3lB2RV38 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rd3lB2RV38 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rd3lB2RV38 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rd3lB2RV38 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rd3lB2RV38 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rd3lB2RV38 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rd3lB2RV38 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rd3lB2RV38 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rd3lB2RV38 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rd3lB2RV38 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rd3lB2RV38 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Rd3lB2RV38 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rd3lB2RV38 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rd3lB2RV38 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rd3lB2RV38 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rd3lB2RV38 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rd3lB2RV38 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rd3lB2RV38 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rd3lB2RV38 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rd3lB2RV38 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rd3lB2RV38 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rd3lB2RV38 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rd3lB2RV38 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rd3lB2RV38 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rd3lB2RV38 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rd3lB2RV38 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rd3lB2RV38 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rd3lB2RV38 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rd3lB2RV38 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rd3lB2RV38 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.7 ms