Protein–RNA interactions for Protein: B0QZW4

Supt3, Suppressor of Ty 3 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt3B0QZW4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Supt3B0QZW4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Supt3B0QZW4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Supt3B0QZW4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Supt3B0QZW4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Supt3B0QZW4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Supt3B0QZW4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Supt3B0QZW4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Supt3B0QZW4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Supt3B0QZW4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Supt3B0QZW4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Supt3B0QZW4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Supt3B0QZW4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Supt3B0QZW4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Supt3B0QZW4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Supt3B0QZW4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Supt3B0QZW4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Supt3B0QZW4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Supt3B0QZW4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Supt3B0QZW4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Supt3B0QZW4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Supt3B0QZW4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Supt3B0QZW4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Supt3B0QZW4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Supt3B0QZW4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Supt3B0QZW4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Supt3B0QZW4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Supt3B0QZW4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Supt3B0QZW4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Supt3B0QZW4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Supt3B0QZW4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Supt3B0QZW4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Supt3B0QZW4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Supt3B0QZW4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Supt3B0QZW4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Supt3B0QZW4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Supt3B0QZW4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Supt3B0QZW4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Supt3B0QZW4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Supt3B0QZW4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Supt3B0QZW4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Supt3B0QZW4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Supt3B0QZW4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Supt3B0QZW4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Supt3B0QZW4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Supt3B0QZW4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Supt3B0QZW4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Supt3B0QZW4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Supt3B0QZW4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Supt3B0QZW4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Supt3B0QZW4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Supt3B0QZW4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Supt3B0QZW4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Supt3B0QZW4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Supt3B0QZW4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Supt3B0QZW4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Supt3B0QZW4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Supt3B0QZW4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Supt3B0QZW4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Supt3B0QZW4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Supt3B0QZW4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Supt3B0QZW4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Supt3B0QZW4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Supt3B0QZW4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Supt3B0QZW4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Supt3B0QZW4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Supt3B0QZW4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Supt3B0QZW4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Supt3B0QZW4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Supt3B0QZW4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Supt3B0QZW4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Supt3B0QZW4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Supt3B0QZW4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Supt3B0QZW4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Supt3B0QZW4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Supt3B0QZW4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Supt3B0QZW4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Supt3B0QZW4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Supt3B0QZW4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Supt3B0QZW4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Supt3B0QZW4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Supt3B0QZW4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Supt3B0QZW4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Supt3B0QZW4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Supt3B0QZW4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Supt3B0QZW4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Supt3B0QZW4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Supt3B0QZW4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Supt3B0QZW4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Supt3B0QZW4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Supt3B0QZW4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Supt3B0QZW4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Supt3B0QZW4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Supt3B0QZW4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Supt3B0QZW4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Supt3B0QZW4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Supt3B0QZW4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Supt3B0QZW4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Supt3B0QZW4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Supt3B0QZW4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms