Protein–RNA interactions for Protein: A2RT81

Rnf39, MCG22610, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf39A2RT81 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf39A2RT81 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf39A2RT81 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf39A2RT81 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf39A2RT81 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf39A2RT81 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnf39A2RT81 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf39A2RT81 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf39A2RT81 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf39A2RT81 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf39A2RT81 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf39A2RT81 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf39A2RT81 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf39A2RT81 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf39A2RT81 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf39A2RT81 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf39A2RT81 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf39A2RT81 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf39A2RT81 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf39A2RT81 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Rnf39A2RT81 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Rnf39A2RT81 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rnf39A2RT81 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Rnf39A2RT81 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Rnf39A2RT81 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rnf39A2RT81 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rnf39A2RT81 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rnf39A2RT81 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rnf39A2RT81 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rnf39A2RT81 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rnf39A2RT81 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rnf39A2RT81 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rnf39A2RT81 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rnf39A2RT81 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rnf39A2RT81 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rnf39A2RT81 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rnf39A2RT81 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Rnf39A2RT81 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rnf39A2RT81 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rnf39A2RT81 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rnf39A2RT81 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rnf39A2RT81 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rnf39A2RT81 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rnf39A2RT81 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnf39A2RT81 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnf39A2RT81 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnf39A2RT81 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnf39A2RT81 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnf39A2RT81 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnf39A2RT81 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rnf39A2RT81 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rnf39A2RT81 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rnf39A2RT81 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rnf39A2RT81 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rnf39A2RT81 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rnf39A2RT81 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf39A2RT81 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf39A2RT81 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf39A2RT81 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf39A2RT81 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf39A2RT81 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf39A2RT81 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rnf39A2RT81 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rnf39A2RT81 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rnf39A2RT81 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rnf39A2RT81 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rnf39A2RT81 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rnf39A2RT81 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rnf39A2RT81 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rnf39A2RT81 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rnf39A2RT81 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rnf39A2RT81 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnf39A2RT81 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnf39A2RT81 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnf39A2RT81 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnf39A2RT81 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnf39A2RT81 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnf39A2RT81 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnf39A2RT81 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf39A2RT81 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf39A2RT81 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rnf39A2RT81 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rnf39A2RT81 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf39A2RT81 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf39A2RT81 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf39A2RT81 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf39A2RT81 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf39A2RT81 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf39A2RT81 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf39A2RT81 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf39A2RT81 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf39A2RT81 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf39A2RT81 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf39A2RT81 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf39A2RT81 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf39A2RT81 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf39A2RT81 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf39A2RT81 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf39A2RT81 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rnf39A2RT81 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms