Protein–RNA interactions for Protein: A2AGU5

Cldn34d, Claudin 34D, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34dA2AGU5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cldn34dA2AGU5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cldn34dA2AGU5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cldn34dA2AGU5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cldn34dA2AGU5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cldn34dA2AGU5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cldn34dA2AGU5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cldn34dA2AGU5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cldn34dA2AGU5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cldn34dA2AGU5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cldn34dA2AGU5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Cldn34dA2AGU5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cldn34dA2AGU5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cldn34dA2AGU5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cldn34dA2AGU5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cldn34dA2AGU5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cldn34dA2AGU5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cldn34dA2AGU5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cldn34dA2AGU5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cldn34dA2AGU5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cldn34dA2AGU5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cldn34dA2AGU5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cldn34dA2AGU5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cldn34dA2AGU5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cldn34dA2AGU5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cldn34dA2AGU5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Cldn34dA2AGU5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cldn34dA2AGU5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cldn34dA2AGU5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cldn34dA2AGU5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cldn34dA2AGU5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cldn34dA2AGU5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cldn34dA2AGU5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cldn34dA2AGU5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cldn34dA2AGU5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cldn34dA2AGU5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cldn34dA2AGU5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cldn34dA2AGU5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cldn34dA2AGU5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cldn34dA2AGU5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cldn34dA2AGU5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cldn34dA2AGU5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Cldn34dA2AGU5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cldn34dA2AGU5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cldn34dA2AGU5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cldn34dA2AGU5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cldn34dA2AGU5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cldn34dA2AGU5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cldn34dA2AGU5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cldn34dA2AGU5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cldn34dA2AGU5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cldn34dA2AGU5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cldn34dA2AGU5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cldn34dA2AGU5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cldn34dA2AGU5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cldn34dA2AGU5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cldn34dA2AGU5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cldn34dA2AGU5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cldn34dA2AGU5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cldn34dA2AGU5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cldn34dA2AGU5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cldn34dA2AGU5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cldn34dA2AGU5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cldn34dA2AGU5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cldn34dA2AGU5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cldn34dA2AGU5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cldn34dA2AGU5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cldn34dA2AGU5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cldn34dA2AGU5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn34dA2AGU5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn34dA2AGU5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn34dA2AGU5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn34dA2AGU5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn34dA2AGU5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn34dA2AGU5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn34dA2AGU5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn34dA2AGU5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn34dA2AGU5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn34dA2AGU5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn34dA2AGU5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn34dA2AGU5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn34dA2AGU5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn34dA2AGU5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cldn34dA2AGU5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cldn34dA2AGU5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cldn34dA2AGU5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cldn34dA2AGU5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cldn34dA2AGU5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cldn34dA2AGU5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cldn34dA2AGU5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn34dA2AGU5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn34dA2AGU5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn34dA2AGU5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn34dA2AGU5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn34dA2AGU5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn34dA2AGU5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn34dA2AGU5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn34dA2AGU5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cldn34dA2AGU5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cldn34dA2AGU5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.2 ms