Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H0

Trbv12-1, T cell receptor beta, variable 12-1 (Fragment), mousemouse

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Length 124 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trbv12-1A0A0B4J1H0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trbv12-1A0A0B4J1H0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trbv12-1A0A0B4J1H0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trbv12-1A0A0B4J1H0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trbv12-1A0A0B4J1H0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trbv12-1A0A0B4J1H0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trbv12-1A0A0B4J1H0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trbv12-1A0A0B4J1H0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Trbv12-1A0A0B4J1H0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trbv12-1A0A0B4J1H0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trbv12-1A0A0B4J1H0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
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