Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WPV9

1700019A02Rik, RIKEN cDNA 1700019A02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700019A02RikA0A087WPV9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
1700019A02RikA0A087WPV9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
1700019A02RikA0A087WPV9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
1700019A02RikA0A087WPV9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
1700019A02RikA0A087WPV9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
1700019A02RikA0A087WPV9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
1700019A02RikA0A087WPV9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
1700019A02RikA0A087WPV9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
1700019A02RikA0A087WPV9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
1700019A02RikA0A087WPV9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
1700019A02RikA0A087WPV9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
1700019A02RikA0A087WPV9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
1700019A02RikA0A087WPV9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
1700019A02RikA0A087WPV9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
1700019A02RikA0A087WPV9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
1700019A02RikA0A087WPV9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
1700019A02RikA0A087WPV9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
1700019A02RikA0A087WPV9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
1700019A02RikA0A087WPV9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
1700019A02RikA0A087WPV9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
1700019A02RikA0A087WPV9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
1700019A02RikA0A087WPV9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
1700019A02RikA0A087WPV9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
1700019A02RikA0A087WPV9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
1700019A02RikA0A087WPV9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
1700019A02RikA0A087WPV9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
1700019A02RikA0A087WPV9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.37
1700019A02RikA0A087WPV9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
1700019A02RikA0A087WPV9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
1700019A02RikA0A087WPV9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
1700019A02RikA0A087WPV9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
1700019A02RikA0A087WPV9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
1700019A02RikA0A087WPV9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
1700019A02RikA0A087WPV9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
1700019A02RikA0A087WPV9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
1700019A02RikA0A087WPV9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
1700019A02RikA0A087WPV9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
1700019A02RikA0A087WPV9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
1700019A02RikA0A087WPV9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
1700019A02RikA0A087WPV9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
1700019A02RikA0A087WPV9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
1700019A02RikA0A087WPV9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
1700019A02RikA0A087WPV9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
1700019A02RikA0A087WPV9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
1700019A02RikA0A087WPV9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
1700019A02RikA0A087WPV9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
1700019A02RikA0A087WPV9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
1700019A02RikA0A087WPV9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
1700019A02RikA0A087WPV9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
1700019A02RikA0A087WPV9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
1700019A02RikA0A087WPV9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
1700019A02RikA0A087WPV9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
1700019A02RikA0A087WPV9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
1700019A02RikA0A087WPV9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
1700019A02RikA0A087WPV9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
1700019A02RikA0A087WPV9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
1700019A02RikA0A087WPV9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
1700019A02RikA0A087WPV9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
1700019A02RikA0A087WPV9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
1700019A02RikA0A087WPV9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
1700019A02RikA0A087WPV9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
1700019A02RikA0A087WPV9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
1700019A02RikA0A087WPV9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
1700019A02RikA0A087WPV9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
1700019A02RikA0A087WPV9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
1700019A02RikA0A087WPV9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
1700019A02RikA0A087WPV9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
1700019A02RikA0A087WPV9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
1700019A02RikA0A087WPV9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
1700019A02RikA0A087WPV9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
1700019A02RikA0A087WPV9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
1700019A02RikA0A087WPV9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
1700019A02RikA0A087WPV9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
1700019A02RikA0A087WPV9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
1700019A02RikA0A087WPV9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
1700019A02RikA0A087WPV9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
1700019A02RikA0A087WPV9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
1700019A02RikA0A087WPV9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
1700019A02RikA0A087WPV9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
1700019A02RikA0A087WPV9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
1700019A02RikA0A087WPV9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
1700019A02RikA0A087WPV9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
1700019A02RikA0A087WPV9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
1700019A02RikA0A087WPV9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms