Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXC10Q9NYD6 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXC10Q9NYD6 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXC10Q9NYD6 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXC10Q9NYD6 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXC10Q9NYD6 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
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HOXC10Q9NYD6 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXC10Q9NYD6 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
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HOXC10Q9NYD6 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
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HOXC10Q9NYD6 AC106858.1-201ENST00000637497 429 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HOXC10Q9NYD6 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
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HOXC10Q9NYD6 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
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HOXC10Q9NYD6 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
HOXC10Q9NYD6 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
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HOXC10Q9NYD6 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HOXC10Q9NYD6 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
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HOXC10Q9NYD6 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HOXC10Q9NYD6 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HOXC10Q9NYD6 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HOXC10Q9NYD6 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HOXC10Q9NYD6 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
HOXC10Q9NYD6 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HOXC10Q9NYD6 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HOXC10Q9NYD6 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HOXC10Q9NYD6 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HOXC10Q9NYD6 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
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