Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 AC022882.1-201ENST00000532142 501 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 AC007527.1-202ENST00000543347 382 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
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FOXQ1Q9C009 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
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FOXQ1Q9C009 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
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FOXQ1Q9C009 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
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FOXQ1Q9C009 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
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FOXQ1Q9C009 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
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FOXQ1Q9C009 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
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FOXQ1Q9C009 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
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FOXQ1Q9C009 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
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FOXQ1Q9C009 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
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FOXQ1Q9C009 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
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FOXQ1Q9C009 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 ELOCP18-201ENST00000434209 337 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXQ1Q9C009 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
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FOXQ1Q9C009 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
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