Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 MAPK10-344ENST00000641718 3746 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 NCOR1-201ENST00000268712 10720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 OR4D5-201ENST00000307033 1095 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 MIR433-201ENST00000384837 93 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 AC084816.1-201ENST00000413794 565 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 CFL1P1-202ENST00000432948 411 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 PTMAP6-201ENST00000439110 327 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 CREM-230ENST00000474931 626 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 AC092824.1-201ENST00000483524 576 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 RN7SL30P-201ENST00000488416 306 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 AC008680.1-201ENST00000523398 283 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 OSBPL9-206ENST00000453295 2842 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 DMD-205ENST00000359836 7339 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 OR9H1P-201ENST00000446393 4888 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 RAB9B-201ENST00000243298 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 TRPM7-201ENST00000313478 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 ATF7IP2-203ENST00000396559 3641 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 TMEM200A-202ENST00000392429 5017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 TEX38-202ENST00000415500 566 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-638P-201ENST00000516582 104 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 PWRN1-208ENST00000567647 561 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 FGF1-213ENST00000610990 3802 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 SMC1A-202ENST00000375340 9930 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 TEX9-203ENST00000558083 4440 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 AC105114.1-201ENST00000624795 1862 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.4 ms