Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ3

C9orf40, Uncharacterized protein C9orf40, humanhuman

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40Q8IXQ3 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
C9orf40Q8IXQ3 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
C9orf40Q8IXQ3 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
C9orf40Q8IXQ3 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
C9orf40Q8IXQ3 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
C9orf40Q8IXQ3 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
C9orf40Q8IXQ3 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
C9orf40Q8IXQ3 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
C9orf40Q8IXQ3 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
C9orf40Q8IXQ3 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
C9orf40Q8IXQ3 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
C9orf40Q8IXQ3 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
C9orf40Q8IXQ3 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
C9orf40Q8IXQ3 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
C9orf40Q8IXQ3 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
C9orf40Q8IXQ3 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
C9orf40Q8IXQ3 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
C9orf40Q8IXQ3 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
C9orf40Q8IXQ3 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
C9orf40Q8IXQ3 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
C9orf40Q8IXQ3 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
C9orf40Q8IXQ3 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
C9orf40Q8IXQ3 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
C9orf40Q8IXQ3 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
C9orf40Q8IXQ3 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
C9orf40Q8IXQ3 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
C9orf40Q8IXQ3 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
C9orf40Q8IXQ3 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
C9orf40Q8IXQ3 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
C9orf40Q8IXQ3 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
C9orf40Q8IXQ3 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
C9orf40Q8IXQ3 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
C9orf40Q8IXQ3 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
C9orf40Q8IXQ3 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
C9orf40Q8IXQ3 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
C9orf40Q8IXQ3 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
C9orf40Q8IXQ3 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
C9orf40Q8IXQ3 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
C9orf40Q8IXQ3 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
C9orf40Q8IXQ3 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
C9orf40Q8IXQ3 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
C9orf40Q8IXQ3 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
C9orf40Q8IXQ3 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
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C9orf40Q8IXQ3 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
C9orf40Q8IXQ3 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
C9orf40Q8IXQ3 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
C9orf40Q8IXQ3 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
C9orf40Q8IXQ3 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
C9orf40Q8IXQ3 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
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C9orf40Q8IXQ3 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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C9orf40Q8IXQ3 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
C9orf40Q8IXQ3 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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C9orf40Q8IXQ3 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
C9orf40Q8IXQ3 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
C9orf40Q8IXQ3 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
C9orf40Q8IXQ3 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
C9orf40Q8IXQ3 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
C9orf40Q8IXQ3 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
C9orf40Q8IXQ3 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
C9orf40Q8IXQ3 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
C9orf40Q8IXQ3 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
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